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Enregistrement W2735669784 · doi:10.1139/cjas-2017-0019

Modelling lactation curves of dairy goats by fitting random regression models using Legendre polynomials or B-splines

2017· article· en· W2735669784 sur OpenAlexaffvenue
Luiz F. Brito, Felipe Gomes da Silva, Hinayah Rojas de Oliveira, N. O. Souza, Giovani da Costa Caetano, Edson Vinícius Costa, G. R. de O. Menezes, Ana Lúcia Puerro de Melo, Marcelo Teixeira Rodrigues, Robledo de Almeida Torres

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLegendre polynomialsMathematicsHeritabilityStatisticsCovarianceResidualQuadratic functionRestricted maximum likelihoodRegressionAdditive genetic effectsPolynomial regressionQuadratic equationEstimation theoryBiologyAlgorithmGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A total of 17 356 test-day milk yield (TDMY) records from 642 first lactations of Alpine goats were used to model variations in lactation curve using random regression models (RRM). Orthogonal Legendre polynomials and B-splines were evaluated to obtain adequate and parsimonious models for the estimation of genetic parameters. The analysis was performed using a single-trait RRM, including the additive genetic, permanent environmental, and residual effects. We estimated the mean trend of milk yield, and the additive genetic and permanent environmental covariance functions through random regression using different orders of orthogonal Legendre polynomial (three to six) and B-spline functions (linear, quadratic, and cubic, with three to six knots). This study further evaluated different number of classes of residual variances. The covariance components and the genetic parameters were estimated using the restricted maximum likelihood method. Heritability estimates presented similar trends for both functions. The RRM with a higher number of parameters better described the genetic variation of TDMY throughout the lactation. The most suitable RRM for genetic evaluation of TDMY of Alpine goats is a quadratic B-spline function with six knots, for the mean trend, curves of additive genetic and permanent environmental effects, and five classes of residual variance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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