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Enregistrement W2735680270 · doi:10.1021/acs.biochem.6b01174

Relationship between Amphipathic β Structures in the β<sub>1</sub> Domain of Apolipoprotein B and the Properties of the Secreted Lipoprotein Particles in McA-RH7777 Cells

2017· article· en· W2735680270 sur OpenAlexfundno aff
Medha Manchekar, Richa Kapil, Zhihuan Sun, Jere P. Segrest, Nassrin Dashti

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of Ottawa
Mots-clésApolipoprotein BMicrosomal triglyceride transfer proteinChemistryAmphiphileSecretionLipoproteinBiochemistryVery low-density lipoproteinPhospholipidCholesterolCopolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our previous studies demonstrated that the first 1000 amino acid residues (the βα 1 domain) of human apolipoprotein (apo) B-100, termed apoB:1000, are required for the initiation of lipoprotein assembly and the formation of a monodisperse stable phospholipid (PL)-rich particle. The objectives of this study were (a) to assess the effects on the properties of apoB truncates undergoing sequential inclusion of the amphipathic β strands in the 700 N-terminal residues of the β 1 domain of apoB-100 and (b) to identify the subdomain in the β 1 domain that is required for the formation of a microsomal triglyceride transfer protein (MTP)-dependent triacylglycerol (TAG)-rich apoB-containing particle. Characterization of particles secreted by stable transformants of McA-RH7777 cells demonstrated the following. (1) The presence of amphipathic β strands in the 200 N-terminal residues of the β 1 domain resulted in the secretion of apoB truncates (apoB:1050 to apoB:1200) as both lipidated and lipid-poor particles. (2) Inclusion of residues 300–700 of the β 1 domain led to the secretion of apoB:1300, apoB:1400, apoB:1500, and apoB:1700 predominantly as lipidated particles. (3) Particles containing residues 1050–1500 were all rich in PL. (4) There was a marked increase in the lipid loading capacity and TAG content of apoB:1700-containing particles. (5) Only the level of secretion of apoB:1700 was markedly diminished by MTP inhibitor BMS-197636. These results suggest that apoB:1700 marks the threshold for the formation of a TAG-rich particle and support the concept that MTP participates in apoB assembly and secretion at the stage where particles undergo a transition from PL-rich to TAG-rich.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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