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Enregistrement W2735944198 · doi:10.1038/s41467-018-02867-z

Ecology and genomics of an important crop wild relative as a prelude to agricultural innovation

2018· article· en· W2735944198 sur OpenAlexafffund
Eric von Wettberg, Peter L. Chang, Fatma BAŞDEMİR, Noelia Carrasquilla‐Garcia, Lijalem Korbu, Susan M. Moenga, Gashaw Bedada, Alex Greenlon, Ken S. Moriuchi, Vasantika Singh, Matilde A. Cordeiro, Nina Noujdina, Kassaye Negash Dinegde, Syed Gul Abbas Shah Sani, Tsegaye Getahun, Lisa Vance, Emily Bergmann, Donna Lindsay, Bullo Erena Mamo, Emily Warschefsky, Emmanuel Dacosta-Calheiros, Edward Marques, Mustafa Abdullah Yılmaz, Ahmet Ş. Çakmak, Janna L. Rose, Andrew Migneault, Christopher P. Krieg, Sevgi Saylak, Hamdi Temel, Maren Friesen, Eleanor Siler, Zhaslan Akhmetov, Hüseyin Özçelik, Jana Kholová, Canan Can, Pooran M. Gaur, Mehmet YILDIRIM, H. C. Sharma, Vincent Vadez, Kassahun Tesfaye, Asnake Fikre Woldemedhin, Bunyamin Tar’an, Abdulkadir Aydoğan, Bekir Bükün, R. Varma Penmetsa, Jens Berger, Abdullah Kahraman, Sergey V. Nuzhdin, Douglas R. Cook

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureSaskatchewan Pulse GrowersWestern Grains Research FoundationMinistry of Agriculture - SaskatchewanHoward Hughes Medical InstituteU.S. Department of AgricultureFlorida International UniversityGrains Research and Development CorporationUnited States Agency for International DevelopmentCrop TrustNational Science Foundation
Mots-clésDomesticationBiologyGenetic diversityAgricultureCropGenomicsTraitGene poolGenetic variationGenetic driftEcologyEvolutionary biologyBiotechnologyAgroforestryGeneticsGenomeGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Domesticated species are impacted in unintended ways during domestication and breeding. Changes in the nature and intensity of selection impart genetic drift, reduce diversity, and increase the frequency of deleterious alleles. Such outcomes constrain our ability to expand the cultivation of crops into environments that differ from those under which domestication occurred. We address this need in chickpea, an important pulse legume, by harnessing the diversity of wild crop relatives. We document an extreme domestication-related genetic bottleneck and decipher the genetic history of wild populations. We provide evidence of ancestral adaptations for seed coat color crypsis, estimate the impact of environment on genetic structure and trait values, and demonstrate variation between wild and cultivated accessions for agronomic properties. A resource of genotyped, association mapping progeny functionally links the wild and cultivated gene pools and is an essential resource chickpea for improvement, while our methods inform collection of other wild crop progenitor species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations203
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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