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Enregistrement W2736161417 · doi:10.1002/art.40208

Brief Report: Clinical and Molecular Phenotypes of Low‐Penetrance Variants of <i><scp>NLRP</scp>3</i>: Diagnostic and Therapeutic Challenges

2017· article· en· W2736161417 sur OpenAlexaff
J. B. Kuemmerle‐Deschner, Deepti Verma, Theresa Endres, Lori Broderick, Adriana A. de Jesus, F Hofer, Norbert Blank, Karoline Krause, Christoph Rietschel, Gerd Horneff, Ivona Aksentijevich, P Lohse, Raphaela Goldbach‐Mansky, Hal M. Hoffman, Susanne M. Benseler

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammasome and immune disorders
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthWenner-Gren Foundation
Mots-clésPenetranceMedicinePhenotypeImmunologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Cryopyrin-associated periodic syndromes (CAPS) result from gain-of-function mutations in the NLRP3 gene, which causes excessive release of interleukin-1β (IL-1β) and systemic inflammation. While pathogenetic NLRP3 variant phenotypes are well-characterized, low-penetrance NLRP3 variants represent a significant clinical challenge. The aims of this study were to determine the clinical phenotype, the in vitro biologic phenotype, and the effect of anti-IL-1 treatment in patients with low-penetrance NLRP3 variants. METHODS: A multicenter study of consecutive symptomatic patients with low-penetrance NLRP3 variants recruited from 7 centers between May 2012 and May 2013 was performed. The observed findings were transferred into a study database, from which they were extracted for analysis. Controls were patients with a known pathogenetic NLRP3 variant. Clinical presentation and CAPS markers of inflammation were captured. Functional assays of inflammasome activation, including caspase 1 activity, NF-κB release, cell death, and IL-1β release, were performed. Treatment effects of IL-1 were determined. Comparisons between low-penetrance and pathogenetic NLRP3 variants were performed. RESULTS: The study included 45 patients, 21 of which were female (47%); 26 of the patients (58%) were children. NLRP3 low-penetrance variants identified in the patients were Q703K (n = 19), R488K (n = 6), and V198M (n = 20). In the controls, 28 had pathogenetic NLRP3 variants. Patients with low-penetrance NLRP3 variants had significantly more fever (76%) and gastrointestinal symptoms (73%); eye disease, hearing loss, and renal involvement were less common. Functional inflammasome testing identified an intermediate phenotype in low-penetrance NLRP3 variants as compared to wild-type and pathogenetic NLRP3 variants. All treated patients responded to IL-1 inhibition, with complete response documented in 50% of patients. CONCLUSION: Patients with low-penetrance NLRP3 variants display a distinct clinical phenotype and an intermediate biologic phenotype, including IL-1β and non-IL-1β-mediated inflammatory pathway activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,248
Score d'incertitude au seuil0,725

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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