<i>Macrococcus canis</i> and <i>M. caseolyticus</i> in dogs: occurrence, genetic diversity and antibiotic resistance
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The discovery of a new Macrococcus canis species isolated from skin and infection sites of dogs led us to question if Macrococcus spp. are common in dogs and are resistant to antibiotics. HYPOTHESIS/OBJECTIVES: To evaluate the occurrence of Macrococcus spp. in dogs, determine antibiotic resistance profiles and genetic relationships. ANIMALS: One hundred and sixty two dogs (mainly West Highland white terriers and Newfoundland dogs) were screened for the presence of Macrococcus, including six dogs with Macrococcus infections. METHODS: Samples were taken from skin, ear canal and oral mucosa using swabs. Macrococci were identified by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry, 16S rRNA sequencing and nuc-PCR. Minimal inhibitory concentrations of 19 antibiotics were determined using broth microdilution. Resistance mechanisms were identified by microarray and sequencing of the fluoroquinolone-determining region of gyrA and grlA. Sequence type (ST) was determined by multilocus sequence typing. RESULTS: Out of the 162 dogs, six harboured M. caseolyticus (n = 6) and 13 harboured M. canis (n = 16). Six isolates of M. canis and one of M. caseolyticus were obtained from infection sites. The 22 M. canis strains belonged to 20 different STs and the seven M. caseolyticus strains to three STs. Resistance to antibiotics was mostly associated with the detection of known genes, with mecB-mediated meticillin resistance being the most frequent. CONCLUSION AND CLINICAL IMPORTANCE: This study gives some insights into the occurrence and genetic characteristics of antibiotic-resistant Macrococcus from dogs. Presence of M. canis in infection sites and resistance to antibiotics emphasized that more attention should be paid to this novel bacteria species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».