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Enregistrement W2737044186

CARACTÉRISTIQUES BIOLOGIQUES D’UN MICROMAMMIFÈRE EN EXPANSION : LA SOURIS À PATTES BLANCHES

2017· article· fr· W2737044186 sur OpenAlexfundno aff
Adrien André

Notice bibliographique

RevueOpen Repository and Bibliography (University of Liège) · 2017
Typearticle
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthUniversité de LiègeFonds De La Recherche Scientifique - FNRS
Mots-clésEnvironmental science
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

J'aimerais commencer par remercier Johan, mon directeur tout au long de ces quatre années de thèse.Tu t'es toujours montré très motivant, tout en me laissant une grande liberté dans mon travail, tu as toujours été très disponible et ce malgré la distance.J'ai découvert au fur et à mesure que nous partagions beaucoup de points de vue, que ce soit dans le domaine scientifique mais aussi dans la vie en général.J'aimerais donc te remercier du fond du cœur Johan, de m'avoir fait confiance dès le début, et de m'avoir soutenu dans les moments un peu plus difficiles.J'aimerais aussi remercier ma co-directrice, Virginie, qui m'a ouvert les portes de son laboratoire à l'université McGill à Montréal.J'ai beaucoup appris en travaillant à tes côtés.Merci pour les nombreux conseils que tu m'as donnés et les multiples relectures qui ont permis d'améliorer grandement la qualité du présent travail et des articles qui le composent.Merci à Alexis Ribas qui m'a initié à la parasitologie et avec qui j'ai beaucoup apprécié collaborer, que ce soit lors d'un séjour à Barcelone ou à Udon Thani.Merci aux deux autres membre de mon comité de thèse, Alain Vanderpoorten et Serge Morand.Merci au Fonds de la Recherche Scientifique -FNRS et au FRIA pour le financement qui a permis la réalisation de cette thèse de doctorat.J'estime être une personne extrêmement chanceuse dans bien des aspects de la vie en général, et particulièrement avec les personnes qui m'entourent.Je saisis donc l'opportunité qui m'est donnée pour les remercier ici.Ma petite famille tout d'abord, avec mes parents, Patrick et Nathalie.Dans le cadre d'une formation, j'ai un jour dû apporter un objet symbolisant mes parents.C'est une carte de scopa que j'avais choisi, le « settebello ».Pourquoi ?Parce que c'est la meilleure carte du jeu, celle que chacun rêve d'avoir dans sa main.Je suis reconnaissant au sort de m'avoir fait naître dans cette famille aimante, qui a toujours su m'encourager dans les différents choix que j'ai entrepris.Je vous aime très fort et j'aimerais vous dédier ce travail qui pour moi représente l'accomplissement de mon éducation que vous avez démarré il y a 30 ans.Merci aussi Maman pour les multiples corrections orthographiques que tu as effectuées.(Cette partie n'est pas passée sous ton œil avisé, j'espère ne pas avoir laissé passer trop d'erreurs !) Ma vie n'aurait pas été aussi colorée sans la présence de mon frère et de ma sœur, Lucas et Irène, qui m'ont vite rejoint avec qui nous formons désormais une fratrie d'enfer !Un grand merci tout particulier à mon amoureuse, Justine.Merci à mes grands-parents, Odile et Philippe ainsi que Jacques et Monique.Merci aussi à mes grandes tantes, Ginette et Odette.Merci à mes oncles et tantes, parrain et marraine, Lydie, Pascal, Jean-Paul et Françoise, Merci à mes cousins, Stéphane, Yann, Marine, Anne-Lise, Paul, Gaétan, Clara, aux valeurs ajoutées -Marianne, Vincent, William -, ainsi qu'à toute la nouvelle génération.Grâce, à vous, le professeur des champignons existera peut-être un jour pour du vrai !Je ne serais pas grand-chose sans toutes ces personnes qui m'ont offert leur précieuse amitié à un moment ou l'autre dans ma vie : À mon meilleur ami François (mon MEILLEUR ami !), à défaut d'être mon frère de sang, tu es mon frère de cœur depuis plus de 15 ans maintenant !merci pour tout ce que tu m'as apporté !À Léo, l'histoire de ma thèse est intimement liée à la tienne.Je te remercie de m'avoir rejoint à Montréal il y a maintenant 6 ans de cela.Ce fut un plaisir de partager tous ces bons moments, ici et là-bas, avec toi.6 À toute la troupe des Grunhaut -Dorian, Justine, Marc, Grand Max, Caro, Fany -il est bon de savoir que vous m'entourez et que je peux compter sur vous.À mes colocs et anciens colocs.Un soir que je n'arrivais pas à m'endormir, j'ai fait le compte des personnes avec qui j'avais partagé un toit.Je me suis arrêté passé les 40, perdu dans les souvenirs que cela a fait remonter.Que ce soit chez les Marquises, à Sherbrooklyn, au Palacio, aux koteaux, à la coloc du frère Orban ou celle du bon vieux curé Ramoux, j'ai à chaque fois vécu de belles expériences, partagé plus que juste un appartement avec de belles personnes, qui m'auront marqué, chacune par leur style de vie, leur originalité propre, leur gentillesse ou encore par leur sens de l'accueil et du partage.La personne qui me fera quitter la vie en collocation devra avoir de bien bons arguments… À mes amis de l'université -Fred, Mouchette, Maxou, Ren, Romo, Lola, Adelin A., Justine, Choupito, Coline, Pierre, Thomas, Oli, Christophe, François, Yvos, Cécile et tous les autres -Vous avez chacun fait, à votre manière que mes 5 ans à l'université soient une aventure à la fois douce, et folle.Je suis enchanté d'avoir gardé contact avec vous tous et d'avoir vécu notre amitié bien au-delà de l'enceinte universitaire, que ce soit pour des séjours à Ténériffe, sur un canot le long d'une rivière au Québec, à vélo dans le Connemara, entre deux scènes de concert à Dour ou à Budapest, dans un gite ardennais ou comblinois, entre deux bars à Dublin et si souvent juste ici à Lidge !A mes amis de secondaires, et plus particulièrement Roulio, Kim, JP, Christophe, Philou et Jon.Les années passent mais vous êtes toujours là !Merci à tous mes oufti-potes de l'équipe d'ultimate de Liège : Ouftimate !Tous les Tchantchès et les Nanesses qui m'ont fait découvrir un sport fabuleux !Merci à mes labmates aussi.En commençant par Alice Mouton, sans qui je n'aurais sûrement jamais commencé cette aventure doctorale.Merci de m'avoir coaché au tout début !Merci aussi à François, avec qui j'ai trouvé très agréable de collaborer et j'espère que cette collaboration se poursuivra pour de nouvelles aventures !Merci aussi à Laurent qui m'a rendu très souvent service ainsi qu'à toutes les autres personnes, chercheurs comme étudiants avec qui j'ai partagé le bureau ou le labo.Merci à mes labmates québécois aussi, en particulier Cédric, Shaun, Robby, Julie, Jorge et Rodrigo, ainsi que tous les autres qui ont participé de près ou de loin aux campagnes d'échantillonnage.Merci à tous mes amis québécois, et en particulier Jean-Martin, la plus belle crisse de personne que j'aie rencontré outratlantique.Merci aux Charlie's Angels et à toute la bande des Nazes.Et puis merci aux inclassables : Victor, malgré que nos vies aient pris des trajectoires différentes, tu es, depuis près de trente ans toujours mon frère de pot !Merci à Fanny, ma sparring partner de toujours, en athlétisme comme à Civilization.Merci à Gaël, mon partner d'escalade préféré !Merci à mes autres partners d'escalade qui m'ont permis de me vider la tête tout comme les bras.Un merci tout particulier à Julie Pitoors qui m'a généreusement proposé les magnifiques dessins figurant dans ce travail.Merci à Philippe Seijkens et Dominique Andrès, deux personnes qui ont été très importantes à des moments différents de ma vie. PréfaceLa science, au fur et à mesure de son évolution, s'est complexifiée.Le temps où de grandes découvertes se faisaient en s'immergeant dans son bain est révolu depuis bien longtemps.Nous vivons à une époque où la plupart des pommes les plus accessibles de l'arbre ont déjà été cueillies.Si l'on veut obtenir sa part, il faut donc s'équiper des meilleurs outils.Or la complexité des méthodes mises en œuvre rend parfois difficile la communication des résultats obtenus.D'une part, j'ai le sentiment que la science est aujourd'hui devenue une discipline trop hermétique.De l'autre, j'observe de plus en plus souvent de courts articles de presse relatant de récentes découvertes scientifiques qui ne s'embarrassent pas de détails trop encombrants, menant alors à des raccourcis simplistes, voire dangereux.Ces résultats de pseudo-vulgarisation, pris pour acquis, sont alors relayés par les réseaux sociaux et des demi-vérités font alors loi pour une grande partie de la population.Il me semble qu'il appartient donc aux scientifiques eux-mêmes de vulgariser leurs recherches, en y incluant les nuances que d' autres préfèrent omettre.J'ai donc souhaité écrire une thèse destinée bien sûr à la communauté scientifique, tout en étant la plus accessible possible pour les personnes non scientifiques de formation.Une attention toute particulière à été portée à l'introduction.J'y relate notamment un bref historique de la biogéographie, ainsi que quelques anecdoctes scientifiques qui m'ont marqué pendant ces cinq années de recherche et qui, je l'espère, maintiendront l'intérêt du lecteur.Après cette introduction suivent les chapitres 2 à 6 qui relatent les différents résultats obtenus tout au long de ce travail.Quatre articles viennent les étoffer.Ils sont rédigés en anglais comme l'exige ce type de travail.Deux sont déjà publiés dans des revues à comité de lecture (Article 1 :

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,172

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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