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Enregistrement W2737201921 · doi:10.4236/ajps.2017.88130

Evaluation of a <i>Brassica napus</i> Auxin-Repressed Gene Induced by Flea Beetle Damage and <i>Sclerotinia sclerotiorum</i> Infection

2017· article· en· W2737201921 sur OpenAlexafffund
Limin Wu, Min Yu, Jennifer Holowachuk, Andrew Sharpe, Derek Lydiate, Dwayne D. Hegedus, Margaret Y. Gruber

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Plant Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensGlobal Institute for Water SecurityUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyJasmonateFlea beetleAuxinArabidopsisCanolaSclerotinia sclerotiorumBiotic stressBotanyArabidopsis thalianaAbiotic stressCell biologyGeneGeneticsMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biotic stresses negatively affect canola growth and production. Flea beetle damage and Sclerotinia sclerotiorum (S. sclerotiorum) infection are two of the worst biotic stresses for canola. Auxin Repressed Proteins (ARPs) responsive to several abiotic stresses have been reported. However, information about ARPs induced by Flea beetle damage and S. sclerotiorum infection, their roles in biotic stress tolerance are still lacking in canola. ESTs for an Auxin Repressed Protein 1 (BnARP1) were highly represented (expressed) in a Brassica napus subtractive library developed after leaf damage by the crucifer flea beetle (Phyllotreta cruciferae). Expression of this gene was under different developmental control in B. napus, and it was co-induced in B. napus by flea beetle feeding, S. sclerotiorum infection, drought and cold. A total of 25 BnARP genes were represented in different B. napus stress and development EST libraries and indicated larger, diversified families than known earlier. Dwarf phenotypes, primary root growth inhibition, lateral root enhancement, reduced sensitivity to 2, 4-D, and reduced PIN1 and LOX expression in transgenic Arabidopsis expression lines suggest that BnARP1 is an auxin repressor that prevents auxin transport and supports an interaction between the auxin and jasmonate signalling pathways. And the increased survival after S. sclerotiorum infection in transgenic over-expression Arabidopsis suggests that BnARP1 could play a role in S. sclerotiorum tolerance through connecting auxin and jasmonate signalling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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