Genetic variation and associations involving Fusarium head blight and deoxynivalenol accumulation in cultivated oat (<i>Avena sativa</i> L.)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Resistance in oats ( Avena sativa L.) to Fusarium graminearum was phenotyped in 424 spring oat lines from North America and Scandinavia and genotyped with 2974 SNP markers. Fusarium head blight ( FHB ), deoxynivalenol ( DON ) content, days to flowering ( DTF ) and days to yellow maturity ( DTM ) were scored in field trials in 2011–12. Trials with phenotypic ranges from 1 to 30 ppm, and sufficient accuracy were obtained by an augmented design and spawn inoculation. Discriminant analysis– PCA identified the different gene pools, with overlaps corresponding to known pedigrees and germplasm exchanges. Structure was negligible and GWAS (genomewide association study) was done using mixed linear models in TASSEL or partial least‐squares regression ( PLSR ). PLSR allows simultaneous analyses of several phenotypes (environments and/or traits) and is a promising tool for GWAS in plants and should be tested in species with sequenced genomes. FHB was associated with phenology QTL s, due to very susceptible early lines from the Midwest. Lines with consistently low DON (and early heading) were identified. Six QTL s for DON were not associated with earliness, including three QTL s reported previously.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle