Identification and characterization of suppressor mutants of stop1
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Proton stress and aluminum (Al) toxicity are major constraints limiting crop growth and yields on acid soils (pH < 5). In Arabidopsis, STOP1 is a master transcription factor that controls the expression of a set of well-characterized Al tolerance genes and unknown processes involved in low pH resistance. As a result, loss-of-function stop1 mutants are extremely sensitive to low pH and Al stresses. RESULTS: Here, we report on screens of an ethyl-methane sulphonate (EMS)-mutagenized stop1 population and isolation of nine strong stop1 suppressor mutants, i.e., the tolerant to proton stress (tps) mutants, with significantly enhanced root growth at low pH (4.3). Genetic analyses indicated these dominant and partial gain-of-function mutants are caused by mutations in single nuclear genes outside the STOP1 locus. Physiological characterization of the responses of these tps mutants to excess levels of Al and other metal ions further classified them into five groups. Three tps mutants also displayed enhanced resistance to Al stress, indicating that these tps mutations partially rescue the hypersensitive phenotypes of stop1 to both low pH stress and Al stress. The other six tps mutants showed enhanced resistance only to low pH stress but not to Al stress. We carried out further physiologic and mapping-by-sequencing analyses for two tps mutants with enhanced resistance to both low pH and Al stresses and identified the genomic regions and candidate loci in chromosomes 1 and 2 that harbor these two TPS genes. CONCLUSION: We have identified and characterized nine strong stop1 suppressor mutants. Candidate loci for two tps mutations that partially rescue the hypersensitive phenotypes of stop1 to low pH and Al stresses were identified by mapping-by-sequencing approaches. Further studies could provide insights into the structure and function of TPSs and the regulatory networks underlying the STOP1-mediated processes that lead to resistance to low pH and Al stresses in Arabidopsis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».