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Enregistrement W2738082385 · doi:10.1038/s41588-018-0090-3

Genome-wide association analyses identify 44 risk variants and refine the genetic architecture of major depression

2018· review· en· W2738082385 sur OpenAlexaff
Naomi R. Wray, Stephan Ripke, Manuel Mattheisen, Maciej Trzaskowski, Enda M. Byrne, Abdel Abdellaoui, Mark J. Adams, Esben Agerbo, Tracy Air, Till F. M. Andlauer, Silviu‐Alin Bacanu, Marie Bækvad‐Hansen, Aartjan T.F. Beekman, Tim B. Bigdeli, Elisabeth B. Binder, Douglas Blackwood, Julien Bryois, Henriette N. Buttenschøn, Jonas Bybjerg‐Grauholm, Na Cai, Enrique Castelao, Jane Christensen, Toni‐Kim Clarke, Jonathan R. I. Coleman, Lucía Colodro‐Conde, Baptiste Couvy‐Duchesne, Nick Craddock, Gregory E. Crawford, Cheynna Crowley, Hassan S. Dashti, Gail Davies, Ian J. Deary, Franziska Degenhardt, Eske M. Derks, Neşe Direk, Conor V. Dolan, Erin C. Dunn, Thalia C. Eley, Nicholas Eriksson, Valentina Escott‐Price, Farnush Hassan Farhadi Kiadeh, Hilary K. Finucane, Andreas J. Forstner, Josef Frank, Héléna A. Gaspar, Michael Gill, Paola Giusti‐Rodríguez, Fernando S. Goes, Scott D. Gordon, Jakob Grove, Lynsey S. Hall, Eilís Hannon, Christine Søholm Hansen, Thomas Folkmann Hansen, Stefan Herms, Ian B. Hickie, Per Hoffmann, Georg Homuth, Carsten Horn, Jouke‐Jan Hottenga, David M. Hougaard, Ming Hu, Craig Hyde, Marcus Ising, Rick Jansen, Fulai Jin, Eric Jorgenson, James A. Knowles, Isaac S. Kohane, Julia Kraft, Warren W. Kretzschmar, Jesper Krogh, Zoltán Kutalik, Jacqueline M. Lane, Yihan Li, Yun Li, Penelope A. Lind, Xiaoxiao Liu, Leina Lu, Donald J. MacIntyre, Dean F. MacKinnon, Robert Maier, Wolfgang Maier, Jonathan Marchini, Hamdi Mbarek, Patrick J. McGrath, Peter McGuffin, Sarah E. Medland, Divya Mehta, Christel M. Middeldorp, Evelin Mihailov, Yuri Milaneschi, Lili Milani, Jonathan Mill, Francis M. Mondimore, Grant W. Montgomery, Sara Mostafavi, Niamh Mullins, Matthias Nauck, Bernard Ng, Michel G. Nivard, Dale R. Nyholt, Paul F. O’Reilly, Högni Óskarsson, Michael J. Owen, Jodie N. Painter, Carsten Bøcker Pedersen, Marianne Giørtz Pedersen, Roseann E. Peterson, Erik Pettersson, Wouter J. Peyrot, Giorgio Pistis, Daniëlle Posthuma, Shaun Purcell, Jorge A. Quiroz, Per Qvist, John P. Rice, Brien P. Riley, Margarita Rivera, Saira Saeed Mirza, Richa Saxena, Robert A. Schoevers, Eva C. Schulte, Ling Shen, Jianxin Shi, Stanley I. Shyn, Engilbert Sigurðsson, Grant B. C. Sinnamon, Johannes H. Smit, Daniel J. Smıth, Hreinn Stefánsson, Stacy Steinberg, Craig A. Stockmeier, Fabian Streit, Jana Strohmaier, Katherine E. Tansey, Henning Teismann, Alexander Teumer, Wesley K. Thompson, Pippa A. Thomson, Thorgeir E. Thorgeirsson, Chao Tian, Matthew Traylor, Jens Treutlein, Vassily Trubetskoy, André G. Uitterlinden, Daniel Umbricht, Sandra Van der Auwera, Albert M. van Hemert, Alexander Viktorin, Peter M. Visscher, Yunpeng Wang, Bradley T. Webb, Shantel Weinsheimer, Jürgen Wellmann, Gonneke Willemsen, Stephanie H. Witt, Yang Wu, Hualin Simon Xi, Jian Yang, Futao Zhang, Volker Arolt, Bernhard T. Baune, Dorret I. Boomsma, Sven Cichon, Udo Dannlowski, E. C. J. de Geus, J. Raymond DePaulo, Enrico Domenici, Katharina Domschke, Tõnu Esko, Hans J. Grabe, Steven P. Hamilton, Caroline Hayward, Andrew C. Heath, David A. Hinds, Kenneth S. Kendler, Stefan Kloiber, Glyn Lewis, Qingqin S. Li, Susanne Lucae, Pamela Madden, Patrik K. E. Magnusson, Nicholas G. Martin, Andrew M. McIntosh, Andres Metspalu, Ole Mors, Preben Bo Mortensen, Bertram Müller‐Myhsok, Merete Nordentoft, Markus M. Nöthen, Michael O‘Donovan, Sara A. Paciga, Nancy L. Pedersen, Brenda W.J.H. Penninx, Roy H. Perlis, David J. Porteous, James B. Potash, Martin Preisig, Marcella Rietschel, Catherine Schaefer, Thomas G. Schulze, Jordan W. Smoller, Henning Tiemeier, Rudolf Uher, Henry Völzke, Myrna M. Weissman, Thomas Werge, Ashley R. Winslow, Cathryn M. Lewis, Douglas F. Levinson, Gerome Breen, Anders D. Børglum, Patrick F. Sullivan

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCilagNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Cancer InstituteNovo NordiskNational Institute on Drug AbuseWellcome TrustNODAI Genome Research Center, Tokyo University of AgricultureMedical Research CouncilNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesH. Lundbeck A/SWestfälische Wilhelms-Universität MünsterBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchAmgenSiemens HealthineersMax-Planck-GesellschaftLundbeckfondenNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteNorthwestern UniversityPfizerNational Human Genome Research InstituteErasmus Medisch CentrumGlaxoSmithKline
Mots-clésBiologyGenome-wide association studyGenetic architectureGenetic associationComputational biologyAssociation (psychology)GeneticsEvolutionary biologySingle-nucleotide polymorphismQuantitative trait locusGenotypeGenePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Major depressive disorder (MDD) is a common illness accompanied by considerable morbidity, mortality, costs, and heightened risk of suicide. We conducted a genome-wide association meta-analysis based in 135,458 cases and 344,901 controls and identified 44 independent and significant loci. The genetic findings were associated with clinical features of major depression and implicated brain regions exhibiting anatomical differences in cases. Targets of antidepressant medications and genes involved in gene splicing were enriched for smaller association signal. We found important relationships of genetic risk for major depression with educational attainment, body mass, and schizophrenia: lower educational attainment and higher body mass were putatively causal, whereas major depression and schizophrenia reflected a partly shared biological etiology. All humans carry lesser or greater numbers of genetic risk factors for major depression. These findings help refine the basis of major depression and imply that a continuous measure of risk underlies the clinical phenotype. A genome-wide association meta-analysis of individuals with clinically assessed or self-reported depression identifies 44 independent risk loci. Comparisons with other psychiatric disorders and candidate gene analyses provide new insights into major depressive disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3 303
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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