Cadmium exposure and age-associated DNA methylation changes in non-smoking women from northern Thailand
Notice bibliographique
Résumé
DNA methylation changes with age, and may serve as a biomarker of aging. Cadmium (Cd) modifies cellular processes that promote aging and disrupts methylation globally. Whether Cd modifies aging processes by influencing establishment of age-associated methylation marks is currently unknown. In this pilot study, we characterized methylation profiles in > 450 000 CpG sites in 40 non-smoking women (age 40–80) differentially exposed to environmental Cd from Thailand. Based on specific gravity adjusted urinary Cd, we classified them as high (HE) and low (LE) exposed and age-matched within 5 years. Urinary Cd was defined as below 2 µg/l in the LE group. We predicted epigenetic age (DNAm-age) using two published methods by Horvath and Hannum and examined the difference between epigenetic age and chronologic age (Δage). We assessed differences by Cd exposure using linear mixed models adjusted for estimated white blood cell proportions, BMI, and urinary creatinine. We identified 213 age-associated CpG sites in our population (P < 10−4). Counterintuitively, the mean Δage was smaller in HE vs. LE (Hannum: 3.6 vs. 7.6 years, P = 0.0093; Horvath: 2.4 vs. 4.5 years, P = 0.1308). The Cd exposed group was associated with changes in methylation (P < 0.05) at 12, 8, and 20 age-associated sites identified in our population, Hannum, and Horvath. From the results of this pilot study, elevated Cd exposure is associated with methylation changes at age-associated sites and smaller differences between DNAm-age and chronologic age, in contrast to expected age-accelerating effects. Cd may modify epigenetic aging, and biomarkers of aging warrant further investigation when examining Cd and its relationship with chronic disease and mortality.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».