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Enregistrement W2738940817 · doi:10.1109/tcbb.2017.2731849

Improving Alzheimer's Disease Classification by Combining Multiple Measures

2017· article· en· W2738940817 sur OpenAlexaff
Jin Liu, Jianxin Wang, Zhenjun Tang, Bin Hu, Fang‐Xiang Wu, Yi Pan

Notice bibliographique

RevueIEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésDiseaseComputer scienceArtificial intelligenceMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several anatomical magnetic resonance imaging (MRI) markers for Alzheimer's disease (AD) have been identified. Cortical gray matter volume, cortical thickness, and subcortical volume have been used successfully to assist the diagnosis of Alzheimer's disease including its early warning and developing stages, e.g., mild cognitive impairment (MCI) including MCI converted to AD (MCIc) and MCI not converted to AD (MCInc). Currently, these anatomical MRI measures have mainly been used separately. Thus, the full potential of anatomical MRI scans for AD diagnosis might not yet have been used optimally. Meanwhile, most studies currently only focused on morphological features of regions of interest (ROIs) or interregional features without considering the combination of them. To further improve the diagnosis of AD, we propose a novel approach of extracting ROI features and interregional features based on multiple measures from MRI images to distinguish AD, MCI (including MCIc and MCInc), and health control (HC). First, we construct six individual networks based on six different anatomical measures (i.e., CGMV, CT, CSA, CC, CFI, and SV) and Automated Anatomical Labeling (AAL) atlas for each subject. Then, for each individual network, we extract all node (ROI) features and edge (interregional) features, and denoted as node feature set and edge feature set, respectively. Therefore, we can obtain six node feature sets and six edge feature sets from six different anatomical measures. Next, each feature within a feature set is ranked by -score in descending order, and the top ranked features of each feature set are applied to MKBoost algorithm to obtain the best classification accuracy. After obtaining the best classification accuracy, we can get the optimal feature subset and the corresponding classifier for each node or edge feature set. Afterwards, to investigate the classification performance with only node features, we proposed a weighted multiple kernel learning (wMKL) framework to combine these six optimal node feature subsets, and obtain a combined classifier to perform AD classification. Similarly, we can obtain the classification performance with only edge features. Finally, we combine both six optimal node feature subsets and six optimal edge feature subsets to further improve the classification performance. Experimental results show that the proposed method outperforms some state-of-the-art methods in AD classification, and demonstrate that different measures contain complementary information.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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