2005 NSIS Graduate Student Prize Winning Paper CLEAR AS MUD: THE TYPE I/TYPE II MODEL FOR DEATH RECEPTOR-INDUCED APOPTOSIS
Notice bibliographique
Résumé
Apoptosis is a highly organized form of cell death that plays an important regulatory role in many biological processes. The relationship between the two classical signalling pathways of apoptosis, the “death receptor” and “mitochondrial” pathways, was only vaguely appreciated until 1998, when death receptor pathway-mediated activation of the mitochondrial pathway was clearly demonstrated for the first time. The “type I/type II” model of death receptor-mediated apoptosis was proposed and subsequently adopted for use in categorizing cells according to the involvement of the mitochondrion during death receptor-induced apoptosis. Since that time, however, different interpretations of the type I/type II cell definition have appeared in the literature and, consequently, the meaning of type I and type II cells has become less clear. L’apoptose est une forme de mort cellulaire tres structuree qui joue un role important de regulation dans un grand nombre de processus biologiques. La relation entre les deux voies de signalisation traditionnelles de l’apoptose, la voie des « recepteurs de mort » et la voie mitochondriale, n’etait connue que vaguement avant 1998, l'annee ou l’activation de la voie mitochondriale par l’intermediaire de la voie des recepteurs de mort a ete clairement demontree pour la premiere fois. Le modele « type I / type II » d’apoptose par l’intermediaire des recepteurs de mort a ete propose puis adopte aux fins de categorisation des cellules en fonction de la participation des mitochondries a cette apoptose. Depuis, differentes interpretations ont toutefois ete formulees dans des ouvrages scientifiques quant a la definition des cellules de type I et de type II et, par consequent, la signification de « cellules de type I » et de « cellules de type II » est devenue moins evidente.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,129 | 0,049 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».