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Enregistrement W2739652403 · doi:10.1161/str.47.suppl_1.wp257

Abstract WP257: Metabolic Profiling in the Plasma of Rats in Response to Aging and Ischemic Stroke by Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

2016· article· en· W2739652403 sur OpenAlexaff
Vijesh J. Bhute, Umadevi V. Wesley, James F. Hatcher, Robert J. Dempsey, Sean P. Palecek

Notice bibliographique

RevueStroke · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensDempsey (Canada)Hatch (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMetaboliteCreatineStroke (engine)Internal medicineIschemiaMagnetic resonance imagingMetabolomicsEndocrinologyBioinformaticsBiologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Metabolic dysfunction is a common hallmark of aging, and it influences the neurodegenerative diseases including stroke incidence and outcome. Several metabolomics-based studies have revealed metabolite biomarkers in stroke patients and yet metabolic changes as a result of aging and focal ischemia/reperfusion (I/R) time are not completely elucidated. In this study, we examined the dysregulation of metabolites in the plasma as a function of age and cerebral ischemic injury. Methods: We compared the metabolic pattern in young (3 months) and older rats (12 months) before, and 2 days after I/R injury. Stroke was induced by middle cerebral artery occlusion. For time course study, plasma samples from younger animals were collected at day 1, 2, 3, 7, 14 and 21 of I/R (n=3). We used Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy and compared the metabolite peaks using spectral binning and targeted profiling. The data was analyzed using one way analysis of variance, principal component analysis (PCA) and hierarchical clustering. Pathway enrichment and topological analysis tools were used to identify the age and stroke responsive metabolic pathways. Results: PCA revealed global differences in plasma of naïve young and old rats, with old rats showing significantly lower glucose levels, and higher formate levels. Also, older animals showed reduced levels of acetate and formate and very high levels of 3-hydroxybutyrate 2 days after I/R. Younger rats showed significant differences starting from day 3 onwards with lower glucose concentration and increased 3-hydroxybutyrate, creatine, formate and glycine concentrations, which remained at a higher level on day 7 of I/R. Interestingly, the metabolic profile of plasma at day 21 of I/R showed similar pattern as that of control naïve animals. Pathway topology analysis revealed enrichment of citric acid cycle and glycine, serine and threonine metabolic pathways in older animals as early as 2 days after I/R. However, younger animals showed a delayed metabolic response after day 3 of I/R. Conclusions: We have demonstrated that the metabolic profile of plasma is altered as a function of age, ischemic stroke and time of reperfusion. These results suggests an important role for imbalance in metabolites in stroke pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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