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Enregistrement W2739772736 · doi:10.1186/s13007-017-0213-3

An improved butanol-HCl assay for quantification of water-soluble, acetone:methanol-soluble, and insoluble proanthocyanidins (condensed tannins)

2017· article· en· W2739772736 sur OpenAlexafffund
Philip‐Edouard Shay, J. A. Trofymow, C. Peter Constabel

Notice bibliographique

RevuePlant Methods · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest ServiceUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTurun YliopistoNorthern Arizona University
Mots-clésTanninProanthocyanidinAcetoneChemistryCondensed tanninExtraction (chemistry)ButanolChromatographyReagentPolyphenolEthanolOrganic chemistryFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Condensed tannins (CT) are the most abundant secondary metabolite of land plants and can vary in abundance and structure according to tissue type, species, genotype, age, and environmental conditions. Recent improvements to the butanol-HCl assay have separately helped quantification of soluble and insoluble CTs, but have not yet been applied jointly. Our objectives were to combine previous assay improvements to allow for quantitative comparisons of different condensed tannin forms and to test protocols for analyses of condensed tannins in vegetative plant tissues. We also tested if the improved butanol-HCl assay can be used to quantify water-soluble forms of condensed tannins. RESULTS: Including ~50% acetone in both extraction solvents and final assay reagents greatly improved the extraction and quantification of soluble, insoluble and total condensed tannins. The acetone-based method also extended the linear portion of standard integration curves allowing for more accurate quantification of samples with a broader range of condensed tannin concentrations. Estimates of tannin concentrations determined using the protocol without acetone were lower, but correlated with values from acetone-based methods. With the improved assay, quantification of condensed tannins in water-soluble forms was highly replicable. The relative abundance of condensed tannins in soluble and insoluble forms differed substantially between tissue types. CONCLUSIONS: The quantification of condensed tannins using the butanol-HCl assay was improved by adding acetone to both extraction and reagent solutions. These improvements will facilitate the quantification of total condensed tannin in tissues containing a range of concentrations, as well as to determine the amount in water-soluble, acetone:MeOH-soluble and insoluble forms. Accurate determination of these three condensed tannin forms is essential for careful investigations of their potentially different physiological and ecological functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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