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Enregistrement W2739779320 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-3395

Abstract 3395: Alternative splicing of the MEAF6 gene promotes neuroendocrine prostate cancer development

2017· article· en· W2739779320 sur OpenAlexaff
Ahn R. Lee, Yinan Li, Ning Xie, Colin C. Collins, Xuesen Dong

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerCancer researchNeuroendocrine differentiationBiologyAlternative splicingProstateCancerRNA splicingGeneExonRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In response to the selection pressures exerted by potent androgen receptor (AR) pathway inhibitors (ARPI), adenocarcinoma prostate cancer (PCa) cells can undergo an adaptive process of cellular phenotype reprogramming termed neuroendocrine trans-differentiation. With this AR-bypass mechanism of survival emerges a lethal treatment-resistant PCa subtype called treatment-induced neuroendocrine PCa (t-NEPC). t-NEPC is becoming a major clinical issue as it is estimated to affect >25% of advanced-stage PCa patients with the level of incidences predicted to rise as a result of the extensive applications of ARPI in the clinic. This underscores the gravity of our aims to delineate the molecular underpinnings of t-NEPC to inform future therapies that prevent or mitigate t-NEPC development. In this study, we have identified a splice variant of the MYST/Esa1-associated factor 6 (MEAF6) gene, MEAF6-1, that is highly expressed in t-NEPC tumor biopsies as well as neuroendocrine cell lines of prostate and lung cancers. We show that the neuronal RNA splicing factor, SRRM4, stimulates MEAF6-1 splicing. Enhanced MEAF6-1 expression in prostate adenocarcinoma cell lines does not induce neuroendocrine trans-differentiation of these cells. Rather, it stimulates cell proliferation, anchorage-independent cell growth, invasion, and xenograft tumor growth. Gene microarray identified that these MEAF6-1 actions are in part mediated by the ID1 and ID3 genes. These findings suggest that the MEAF6-1 variant does not induce neuroendocrine differentiation of prostate cancer cells, but facilitates t-NEPC progression through accelerating proliferation of cells that have acquired neuroendocrine phenotypes. Citation Format: Ahn R. Lee, Yinan Li, Ning Xie, Colin C. Collins, Xuesen Dong. Alternative splicing of the MEAF6 gene promotes neuroendocrine prostate cancer development [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 3395. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-3395

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,144
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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