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Enregistrement W2739852572 · doi:10.1158/1055-9965.epi-17-0075

Lack of Association for Reported Endocrine Pancreatic Cancer Risk Loci in the PANDoRA Consortium

2017· article· en· W2739852572 sur OpenAlexaff
Daniele Campa, Ofure Obazee, Manuela Pastore, Francesco Panzuto, Valbona Liço, William Greenhalf, Verena Katzke, Francesca Tavano, Eithne Costello, Vincenzo Corbo, Renata Talar‐Wojnarowska, Oliver Strobel, Carlo‐Federico Zambon, John P. Neoptolemos, Giulia Zerboni, Rudolf Kaaks, Timothy J. Key, Carlo Lombardo, Krzysztof Jamroziak, Domenica Gioffreda, Thilo Hackert, Kay‐Tee Khaw, Stefano Landi, Anna Caterina Milanetto, Luca Landoni, Rita T. Lawlor, Franco Bambi, Felice Pirozzi, Daniela Basso, Claudio Pasquali, Gabriele Capurso, Federico Canzian

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UKPancreatic Cancer UK
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismContext (archaeology)DiseaseEtiologyGenetic associationBioinformaticsPancreatic cancerMedicineCancerBiologyOncologyInternal medicineGenotypeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs) are rare neoplasms for which very little is known about either environmental or genetic risk factors. Only a handful of association studies have been performed so far, suggesting a small number of risk loci. Methods: To replicate the best findings, we have selected 16 SNPs suggested in previous studies to be relevant in PNET etiogenesis. We genotyped the selected SNPs (rs16944, rs1052536, rs1059293, rs1136410, rs1143634, rs2069762, rs2236302, rs2387632, rs3212961, rs3734299, rs3803258, rs4962081, rs7234941, rs7243091, rs12957119, and rs1800629) in 344 PNET sporadic cases and 2,721 controls in the context of the PANcreatic Disease ReseArch (PANDoRA) consortium. Results: After correction for multiple testing, we did not observe any statistically significant association between the SNPs and PNET risk. We also used three online bioinformatic tools (HaploReg, RegulomeDB, and GTEx) to predict a possible functional role of the SNPs, but we did not observe any clear indication. Conclusions: None of the selected SNPs were convincingly associated with PNET risk in the PANDoRA consortium. Impact: We can exclude a major role of the selected polymorphisms in PNET etiology, and this highlights the need for replication of epidemiologic findings in independent populations, especially in rare diseases such as PNETs. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev; 26(8); 1349–51. ©2017 AACR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,148
Tête enseignante GPT0,479
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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