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Enregistrement W2739860370 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-5528

Abstract 5528: The protein phosphatase 2A regulatory subunit PR70 is a gonosomal melanoma tumor suppressor gene

2017· article· en· W2739860370 sur OpenAlexaff
Léon C.L.T. van Kempen, Margaret Redpath, Mounib Elchebly, Kathleen Klein, Andreas I. Papadakis, James Willmott, Richard A. Scolyer, Per‐Henrik Edqvist, Fredrik Pontén, Dirk Schadendorf, Anke van Rjk, Stefan Michiels, Anne Dumay, A. Leclerc, Philippe Dessen, Jasper Wouters, Marguerite Stass, Celia M.T. Greenwood, G. E. Ghanem, Joost van den Oord, Jean Feunteun, Alan Spatz

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensJewish General HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMelanomaSuppressorDNA replicationProtein subunitGeneBiologyChromosomePhosphataseCancerProtein phosphatase 2Tumor suppressor geneMetastasisMolecular biologyGeneticsCancer researchPhosphorylationCarcinogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Male gender is independently and significantly associated with poor prognosis in melanoma of all clinical stages. The biological underpinnings of this sex difference remain largely unknown, but we hypothesize that gene expression from gonosomes may play an important role. The current study demonstrates that loss of the inactivated X chromosome in melanomas arising in females is strongly associated with poor distant metastasis-free survival, suggesting a dosage benefit of two X-chromosomes. The gonosomal PPP2R3B gene is located on the pseudo-autosomal region (PAR) of the X-chromosome in females and on the Y-chromosome in males. We observed that despite its location on the PAR that predicts equal dosage across genders, PPP2R3B expression is lower in males than in females, and is independently correlated with poor clinical outcome. PPP2R3B codes for the PR70 protein, a regulatory substrate recognizing subunit of PP2A, that decreases melanoma growth by negatively interfering with DNA replication and cell cycle progression through its role in stabilizing CDC6/CDT1 interaction that delays the firing of origins of DNA replication. As such, PR70 behaves functionally as an X-linked tumor suppressor gene. Citation Format: Léon C.L. Van Kempen, Margaret Redpath, Mounib Elchebly, Kathleen Oros Klein, Andreas Papadakis, James Willmott, Richard Scolyer, Per-Henrik Edqvist, Fredrik Ponten, Dirk Schadendorf, Anke van Rjk, Stefan Michiels, Anne Dumay, Anne Helbling-Leclerc, Philippe Dessen, Jasper Wouters, Marguerite Stass, Celia Greenwood, G. Elias Ghanem, Joost van den Oord, Jean Feunteun, Alan Spatz. The protein phosphatase 2A regulatory subunit PR70 is a gonosomal melanoma tumor suppressor gene [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 5528. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-5528

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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