Abstract 5528: The protein phosphatase 2A regulatory subunit PR70 is a gonosomal melanoma tumor suppressor gene
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Male gender is independently and significantly associated with poor prognosis in melanoma of all clinical stages. The biological underpinnings of this sex difference remain largely unknown, but we hypothesize that gene expression from gonosomes may play an important role. The current study demonstrates that loss of the inactivated X chromosome in melanomas arising in females is strongly associated with poor distant metastasis-free survival, suggesting a dosage benefit of two X-chromosomes. The gonosomal PPP2R3B gene is located on the pseudo-autosomal region (PAR) of the X-chromosome in females and on the Y-chromosome in males. We observed that despite its location on the PAR that predicts equal dosage across genders, PPP2R3B expression is lower in males than in females, and is independently correlated with poor clinical outcome. PPP2R3B codes for the PR70 protein, a regulatory substrate recognizing subunit of PP2A, that decreases melanoma growth by negatively interfering with DNA replication and cell cycle progression through its role in stabilizing CDC6/CDT1 interaction that delays the firing of origins of DNA replication. As such, PR70 behaves functionally as an X-linked tumor suppressor gene. Citation Format: Léon C.L. Van Kempen, Margaret Redpath, Mounib Elchebly, Kathleen Oros Klein, Andreas Papadakis, James Willmott, Richard Scolyer, Per-Henrik Edqvist, Fredrik Ponten, Dirk Schadendorf, Anke van Rjk, Stefan Michiels, Anne Dumay, Anne Helbling-Leclerc, Philippe Dessen, Jasper Wouters, Marguerite Stass, Celia Greenwood, G. Elias Ghanem, Joost van den Oord, Jean Feunteun, Alan Spatz. The protein phosphatase 2A regulatory subunit PR70 is a gonosomal melanoma tumor suppressor gene [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 5528. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-5528
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».