A Potential Role for the <b><i>NOD1</i></b> Variant <b><i>(</i></b>rs6958571) in Gram-Positive Blood Stream Infection in ELBW Infants
Notice bibliographique
Résumé
<b><i>Background:</i></b> The genetic basis of sepsis susceptibility in preterm infants remains understudied. Herein, we investigated the nucleotide binding-oligomerization domain (NOD)-like receptor (NLR) family of immune receptors as putative loci for preterm sepsis susceptibility. <b><i>Objective:</i></b> To determine whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NLR genes are associated with blood stream infections (BSI) in premature infants. <b><i>Methods:</i></b> An international cohort of infants with gestational age (GA) <35 weeks were genotyped for SNPs in the <i>ATG16L1</i>, <i>CARD8</i>, <i>NLRP3</i>, <i>NOD2</i>, and <i>NOD1 </i>genes. &#x03C7;<sup>2</sup> and logistic regression analyses were used to examine relationships between NLR variants and BSI. <b><i>Results:</i></b> Among 764 infants, 138 developed BSI, 113 had gram-positive bacterial (GPB) BSI, and 28 had gram-negative bacterial (GNB) BSI. Infants with BSI had a lower birth weight and GA (<i>p</i> < 0.001), but did not differ in gender, race, or chorioamnionitis. <i>NLR</i> variants were not associated with GPB or GNB BSI in the entire cohort. The CC genotype of the NOD1 SNP <i>(</i>rs6958571) was associated with increased GPB BSI in extremely low birth weight (ELBW, birth weight <1,000 g) infants (OR = 3.3, 95% CI: 1.4-7.5, <i>p</i> = 0.003, <i>n</i> = 362) and in Caucasian infants (OR = 2.5, 95% CI: 1.2-5.4, <i>p</i> = 0.016, <i>n</i> = 535). Regression models adjusting for clinical variables identified ELBW status and the <i>NOD1</i> CC genotype as risk factors for GPB BSI in Caucasian infants. <b><i>Conclusions:</i></b> In this study investigating relationships between <i>NLR</i> variants and sepsis in infants with GA <35 weeks, the <i>NOD1 (</i>rs6958571) SNP was associated with GPB BSI in Caucasian infants and ELBW infants. Replication of our results in an independent cohort would support a role for NLR variants in determining sepsis risk in ELBW infants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».