Abstract 2741: Assessing the utility of circulating tumor DNA as a surveillance tool for sarcomas and Li-Fraumeni syndrome using a pre-clinical model
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Li-Fraumeni Syndrome (LFS) is a hereditary cancer predisposition syndrome commonly characterized by the presence of inherited mutations in the tumor suppressor gene TP53. This leads to an early onset of a wide spectrum of tumors in multiple organ systems. Current surveillance protocols for early tumor detection include biochemical screening, MRI and ultrasound scans, colonoscopy and mammography (for adults). While early detection is associated with improved survival, the complexity of testing, potential to ‘misdiagnose’ tumors (false positive/negative) and requirement for multiple imaging modalities makes clinical surveillance challenging to implement and interpret. Liquid biopsies are a recently described diagnostic and prognostic tool that takes advantage of analyzing circulating tumor DNA - fragmented genomic material that are released into the blood from dying tumor cells. In this proof-of-principle study, we use mouse xenograft tumor models to assess the dynamic relationship between tumor burden and ctDNA concentrations, as well as resolve the sensitivity of capturing the presence of lesions in their earliest stages of growth. Longitudinal analyses of ctDNA from serially collected blood were performed on mice with xenografts of rhabdomyosarcoma (Rh4 and Rh30), osteosarcoma (HOS) and non-small cell lung carcinoma (H1975) of both localized and simulated metastatic tumors. We characterized ctDNA using droplet digital PCR (ddPCR) for known gene mutations that were specific for the cancer cell lines used. We observe obvious increases in ctDNA with increased tumor burden and a complete clearance of ctDNA after tumor resection. In addition, using the metastatic model, we have conducted synchronized imaging and blood-based biopsies to determine the smallest lesion able to be detected in the blood by ctDNA. These studies provide the foundation for early tumor detection with ctDNA in Trp53 mutant mice that develop spontaneous tumors analogous to LFS. This model will help further our understanding on the utility of ctDNA as a surveillance and diagnostic tool for LFS as well as assess its potential for clinical use. Citation Format: Sangeetha Paramathas, Nathan Lewis, Tanya Guha, Zainab Motala, David Malkin. Assessing the utility of circulating tumor DNA as a surveillance tool for sarcomas and Li-Fraumeni syndrome using a pre-clinical model [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 2741. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-2741
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».