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Enregistrement W2740138340 · doi:10.1186/s40409-017-0126-7

BaltDC: purification, characterization and infrared spectroscopy of an antiplatelet DC protein isolated from Bothrops alternatus snake venom

2017· article· en· W2740138340 sur OpenAlexfundno aff
Mariana Santos Matias, Bruna Barbosa de Sousa, Déborah Fernanda da Cunha Pereira, Edigar Henrique Vaz Dias, Carla Cristine Neves Mamede, Mayara Ribeiro de Queiroz, Anielle Christine Almeida Silva, Noélio O. Dantas, Andreimar M. Soares, Júnia de Oliveira Costa, Fábio de Oliveira

Notice bibliographique

Revue˜The œJournal of venomous animals and toxins including tropical diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVenomous Animal Envenomation and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidade Estadual PaulistaFundação Oswaldo CruzFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisFinanciadora de Estudos e ProjetosInstitute of GeneticsInstituto Nacional de Ciência e Tecnologia em ToxinasConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoUniversidade Federal de UberlândiaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorUniversidad Internacional de La Rioja
Mots-clésSnake venomBothropsEdman degradationChemistryVenomBiochemistrySephadexSize-exclusion chromatographyGel electrophoresisMolecular massChromatographyPlateletPolyacrylamide gel electrophoresisPeptide sequenceEnzymeBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Snake venoms are a complex mixture of proteins, organic and inorganic compounds. Some of these proteins, enzymatic or non-enzymatic ones, are able to interact with platelet receptors, causing hemostatic disorders. The possible therapeutic potential of toxins with antiplatelet properties may arouse interest in the pharmacological areas. The present study aimed to purify and characterize an antiplatelet DC protein from Bothrops alternatus snake venom. The protein, called BaltDC (DC protein from B. alternatus snake venom), was purified by a combination of ion-exchange chromatography on DEAE-Sephacel column and gel filtration on Sephadex G-75. The molecular mass was estimated by polyacrylamide gel electrophoresis in the presence of sodium dodecyl sulfate (SDS-PAGE). The amino acid sequence of the N-terminal region was carried out by Edman degradation method. Platelet aggregation assays were performed in human platelet-rich plasma (PRP). Infrared (IR) spectroscopy was used in order to elucidate the interactions between BaltDC and platelet membrane. BaltDC ran as a single protein band on SDS-PAGE and showed apparent molecular mass of 32 kDa under reducing or non-reducing conditions. The N-terminal region of the purified protein revealed the amino acid sequence IISPPVCGNELLEVGEECDCGTPENCQNECCDA, which showed identity with other snake venom metalloproteinases (SVMPs). BaltDC was devoid of proteolytic, hemorrhagic, defibrinating or coagulant activities, but it showed a specific inhibitory effect on platelet aggregation induced by ristocetin and epinephrine in PRP. IR analysis spectra strongly suggests that PO3 2− groups, present in BaltDC, form hydrogen bonds with the PO2 − groups present in the non-lipid portion of the membrane platelets. BaltDC may be of medical interest since it was able to inhibit platelet aggregation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,936
Score d'incertitude au seuil0,514

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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