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Enregistrement W2740328978 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-1242

Abstract 1242: Ornithine decarboxylase as a therapeutic target in endometrial cancer

2017· article· en· W2740328978 sur OpenAlexaff
Hong Im Kim, Chad R. Schultz, Andrea L. Buras, Elizabeth Friedman, Alyssa Fedorko, Leigh G. Seamon, Gadisetti V.R. Chandramouli, André S. Bachmann, John I. Risinger

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCanadian Association of Emergency Physicians
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOrnithine decarboxylaseEndometrial cancerMedicineHazard ratioOncologyCancerCohortCancer researchInternal medicineClinical trialBiomarkerBiologyEnzymeConfidence intervalGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Endometrial cancer is the 4th most common cancer and the 6th deadliest cancer in US women. The American Cancer Society estimates there will be 60,050 new endometrial cancers in 2016, an increase of more than 10% from the previous year highlighting the need for more effective treatments and prevention. Ornithine Decarboxylase (ODC) a key enzyme in polyamine synthesis is often overexpressed in cancers and contributes to cell proliferation and tumor growth. Therefore, ODC and the polyamine pathway are considered rational targets for cancer treatment or prevention. We noted ubiquitous expression of ODC1 in our previously published endometrial cancer gene array data and confirmed this in the cancer genome atlas (TCGA), finding expression in all four molecular sub-types with highest expression in copy number high cancers which have the worst clinical outcomes. Therefore, we explored the association of ODC1 gene expression with clinical outcomes of overall survival (OS) and recurrence in the TCGA cohort and noted that elevated ODC1 was significantly related to OS (Wald test p=0.001) and recurrence (p=0.01). Importantly, we confirmed these observations using QRT-PCR in a validation cohort of 60 endometrial cancers and found that endometrial cancers with elevated ODC1 had significantly shorter recurrence-free intervals (p=5.59x10-5) and elevated hazard ratio=3.72. Similar to TCGA data we also noted a strong trend to worse OS ( p=0.00014) with elevated hazard ratio 3.81. Numerous studies including clinical trials have examined the chemopreventive and anti-tumor effects of difluoromethylornithine (DFMO), a specific inhibitor of ODC. We found that DFMO treatment significantly reduced cell proliferation, cell viability, and colony formation in human cell line models derived from undifferentiated, endometrioid, serous, MMT and clear cell endometrial cancers. In contrast, immortalized uterine endometrial epithelial cells (EM E6/E7 TERT1) were less sensitive to DFMO. To confirm the significant effects of DFMO in vitro we performed an in vivo study with human endometrial cancer (ACI-98) tumor-bearing athymic nude mice. Xenografted mice were either treated with 2% (w/v) DFMO supplied in drinking water or water only (n=10/group). DFMO significantly reduced the tumor burden in mice compared to controls (p=0.0023). ODC-regulated polyamines (putrescine [Put] and spermidine [Spd]) known activators of cell proliferation were strongly decreased in response to DFMO, in both tumor tissue ([Put] (p=0.0006), [Spd] (p<0.0001)) and blood plasma ([Put] (p<0.0001), [Spd] (p=0.0049)) of treated mice. Results of these studies indicate that some endometrial cancers appear particularly sensitive to DFMO. Our findings indicate that the polyamine pathway in endometrial cancers in general and specifically those most clinically relevant endometrial cancers could be targeted for effective treatment, chemoprevention or chemoprevention of recurrence. Citation Format: Hong Im Kim, Chad R. Schultz, Andrea L. Buras, Elizabeth Friedman, Alyssa M. Fedorko, Leigh G. Seamon, Gadisetti Chandramouli, André S. Bachmann, John I. Risinger. Ornithine decarboxylase as a therapeutic target in endometrial cancer [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 1242. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-1242

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,459
Écart entre enseignants0,358 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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