Abstract 4741: Biomarker significance of plasma and tumor miR-21, miR-221, and miR-106a in pediatric osteosarcoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Osteosarcoma is the most common malignant bone tumor in children and young adults. Despite the use of surgery and multi-agent chemotherapy, osteosarcoma patients who respond poorly towards chemotherapy or develop relapses have a dismal outcome. Identification of biomarkers for active disease may help to monitor tumor burden, detect early relapses, and predict prognosis in these patients, so that they can be treated as early as possible to improve their survival. In this study, we examined if circulating microRNAs (miRNAs) can be used as biomarkers in osteosarcoma patients. We performed genome-wide miRNA profiling on a discovery cohort of OS plasma samples (n=32) collected from the Texas Children’s Hospital. A total of 56 miRNAs were upregulated and 164 miRNAs were downregulated in osteosarcoma samples when compared to normal plasma samples (n=8). miRNA-21, miR-221 and miRNA-106a were selected for further validation based on their known biological importance. We showed that all three circulating miRNAs were expressed significantly higher in OS samples (n=29) than normal samples (n=17) in an independent cohort obtained from the Children’s Oncology Group. Furthermore, we demonstrated that miR-21 was expressed significantly higher in osteosarcoma tumors (n=89) compared with normal bone controls. More importantly, lower expressions of miR-21 and miR-221, but not miR-106a, significantly correlated with a poor outcome. In conclusion, our results indicate that miR-21, miR-221 and miR-106a are elevated in the circulation of osteosarcoma patients, whereas tumor expressions of miR-21 and miR-221 are prognostically significant. Further investigation of the miRNAs may lead to a better prognostic method and potential miRNA therapeutics for osteosarcoma. Citation Format: Manjula Nakka, Wendy Allen-Rhoades, Yiting Li, Aaron Kelly, Jianhe Shen, Aaron Taylor, Donald A. Barkauskas, Jason Yustein, Irene Andrulis, Jay Wunder, Richard Gorlick, Paul Meltzer, Ching Lau, Tsz-Kwong Man. Biomarker significance of plasma and tumor miR-21, miR-221, and miR-106a in pediatric osteosarcoma [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 4741. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-4741
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».