Abstract 4722: Evaluation of the prognostic value of ATG4B expression in different breast cancer subtypes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Autophagy, a lysosome-mediated degradation and recycling process, functions as an adaptive survival response during various stressful conditions including hypoxia and chemotherapy. The cysteine protease ATG4B, an important component of the autophagy pathway, is becoming a promising therapeutic target, but its value as a prognostic marker in breast cancer has not been investigated yet. Our recent studies established a novel association between ATG4B and HER2 positive breast cancer. Objective: The aim of this study was to investigate the prognostic value of ATG4B in different breast cancer subtypes using a large population-based cohort. Methods/Experimental Design: We evaluated ATG4B cytoplasmic expression by immunohistochemistry on tissue microarrays constructed from a cohort of 2003 breast cancer patients seen at the British Columbia Cancer Agency. For this large, well-characterized cohort detailed clinical information was available, including age, histology, tumor grade, tumor size, lymph node status, type of local and adjuvant systemic therapy, and dates of first recurrence and death. Median follow-up time was 12.4 years. ATG4B expression was scored by two independent observers using a categorized H-score system. Survival analyses were performed using the Kaplan-Meier function and Cox proportional hazards regression models to evaluate the association of ATG4B expression with breast cancer-specific survival, stratified by intrinsic subtype. Results: ATG4B expression was significantly lower in basal-like vs. non-basal (p<0.001), basal vs. HER2 overexpressed (p=0.0029), and triple-negative vs. non-triple-negative (p<0.001) breast cancer subtypes. In HER2 positive breast cancers, high (H-score >200) ATG4B expression was significantly associated with poor overall survival (hazard ratio (HR) =1.90, 95% confidence interval (CI) =1.10 to 3.27, p=0.033), disease specific survival (HR=2.23, CI =1.23 to 4.04, p=0.016), and relapse-free survival (HR=1.92, CI=1.09 to 3.39, p=0.037). However, in Luminal A breast cancers, high (H-score>150) ATG4B expression was strongly associated with improved overall survival (HR=0.71, CI=0.55 to 0.93, p=0.012) and disease-specific survival (HR=0.43, CI=0.26 to 0.67, p=0.00009). Conclusion: High ATG4B expression is a poor prognostic marker in HER2 positive breast cancer, but a favorable prognostic factor in the Luminal A subtype. Validation analyses are planned on a further set of 1989 cases. Citation Format: Svetlana Bortnik, Basile Tessier Cloutier, Jamie Magrill, Samuel Leung, Aline Talhouk, Karen Gelmon, Stephen Yip, Tony NG, Torsten Nielsen, Sharon Gorski. Evaluation of the prognostic value of ATG4B expression in different breast cancer subtypes [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 4722. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-4722
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».