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Enregistrement W2740997657 · doi:10.1038/s41598-017-08213-5

Characterization of C-terminal structure of MinC and its implication in evolution of bacterial cell division

2017· article· en· W2740997657 sur OpenAlexafffund
Shaoyuan Yang, Qingya Shen, Shu Wang, Song Chen, Zhen Lei, Shengnan Han, Xiaoying Zhang, Jimin Zheng, Zongchao Jia

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Synchrotron Radiation Research CenterNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésThermotoga maritimaCell divisionDivision (mathematics)CellCell biologyBiologyCell growthComputational biologyAsymmetric cell divisionHelix (gastropod)ChemistryEscherichia coliGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Proper cell division at the mid-site of Gram-negative bacteria reflects stringent regulation by the min system (MinC, MinD and MinE). Herein we report crystal structure of the C-terminal domain of MinC from Escherichia coli (EcMinCCTD). The MinCCTD beta helical domain is engaged in a tight homodimer, similar to Thermotoga maritima MinCCTD (TmMinCCTD). However, both EcMinCCTD and TmMinCCTD lack an α-helix (helix3) at their C-terminal tail, in comparison to Aquifex aerolicu MinCCTD (AaMinCCTD) which forms an extra interaction interface with MinD. To understand the role of this extra binding element in MinC/MinD interactions, we fused this helix (Aahelix3) to the C-terminus of EcMinC and examined its effect on cell morphology and cell growth. Our results revealed that Aahelix3 impaired normal cell division in vivo. Furthermore, results of a co-pelleting assay and binding free energy calculation suggested that Aahelix3 plays an essential role in AaMinCD complex formation, under the circumstance of lacking MinE in A. aerolicu. Combining these results with sequence analysis of MinC and MinD in different organisms, we propose an evolutionary relationship to rationalize different mechanisms in cell division positioning in various organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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