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Enregistrement W2741071796 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-608

Abstract 608: Augmenting and broadening T cell responses against mutated tumour neo-antigens

2017· article· en· W2741071796 sur OpenAlexaff
Bruce Robinson, Shaokang Ma, Jonathan Chee, Craig M. Rive, Paula van Miert, Rob Holt, Jenette Creaney

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCTL*AntigenImmunologyCytotoxic T cellImmune systemImmunotherapyVaccinationContext (archaeology)Cancer immunotherapyFOXP3Tumor antigenCancer researchBiologyMedicineCD8In vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cytotoxic T lymphocytes (CTLs) recognize mutated tumor proteins (neo-antigens) and are important for anti-tumor immunity, especially in the context of immune checkpoint blockade immunotherapy (ICPB). Positive outcomes to ICPB are associated with high neo-antigen loads and with neo-antigen specific CTL responses. However only around 20% of patients respond to ICPB. In order to examine ways in which the non-responders might become responders we examined several strategies to improve response rates, using anti-CTLA4 initially as the ICPB therapy in BALB/c mice in which Uqcrc2 has been defined as a DNA/RNAseq-identified neo-antigen in AB1 tumor lines induced by a relevant human carcinogen(1). a) We first examined therapy-induced changes in T-cell responses against Uqcrc2. Anti-CTLA4 alone increased the magnitude of responses against Uqcrc2. Anti-CTLA4 combined with anti-GITR induced determinant spreading, unmasked responses against a new neo-antigen UNC45A that was undetectable during normal tumour growth. Immunogenic chemotherapy also unmasked responses against UNC45A, suggesting that subdominant neo-antigens can be unmasked by the appropriate immunotherapy. b) We then evaluated neo-antigen vaccination strategies. Uqcrc2 vaccination only protected against tumor growth when administered in combination with partial Treg depletion (Foxp3.DTR mice), suggesting that neo-antigen vaccination will only be maximally effective when administered in combination with therapies that modulate existing immune restraints, including Tregs. c) We determined optimal anatomical location for tracking neo-antigen CTL responses and identified the draining lymph node as an optimal, though not exclusive, location for response testing compared to blood or tumor. We are currently examining these observations using sequencing-defined neo-antigens in our patients and will present data on changes in human neo-antigen responses to therapy. These observations have important translational implications for identification of key neo-antigens, choice of therapy and monitoring of anti-tumor responses. 1. J. Creaney et al., Strong spontaneous tumor neoantigen responses induced by a natural human carcinogen. Oncoimmunology 4, e1011492 (2015). Citation Format: Bruce W. Robinson, Shaokang Ma, Jonathan Chee, Craig Rive, Paula Van Miert, Rob A. Holt, Jenette Creaney. Augmenting and broadening T cell responses against mutated tumour neo-antigens [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 608. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-608

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,116
Tête enseignante GPT0,436
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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