Dramatic Differences in Gut Bacterial Densities Correlate with Diet and Habitat in Rainforest Ants
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Abundance is a key parameter in microbial ecology, and important to estimates of potential metabolite flux, impacts of dispersal, and sensitivity of samples to technical biases such as laboratory contamination. However, modern amplicon-based sequencing techniques by themselves typically provide no information about the absolute abundance of microbes. Here, we use fluorescence microscopy and quantitative polymerase chain reaction as independent estimates of microbial abundance to test the hypothesis that microbial symbionts have enabled ants to dominate tropical rainforest canopies by facilitating herbivorous diets, and compare these methods to microbial diversity profiles from 16S rRNA amplicon sequencing. Through a systematic survey of ants from a lowland tropical forest, we show that the density of gut microbiota varies across several orders of magnitude among ant lineages, with median individuals from many genera only marginally above detection limits. Supporting the hypothesis that microbial symbiosis is important to dominance in the canopy, we find that the abundance of gut bacteria is positively correlated with stable isotope proxies of herbivory among canopy-dwelling ants, but not among ground-dwelling ants. Notably, these broad findings are much more evident in the quantitative data than in the 16S rRNA sequencing data. Our results provide quantitative context to the potential role of bacteria in facilitating the ants' dominance of the tropical rainforest canopy, and have broad implications for the interpretation of sequence-based surveys of microbial diversity.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle