Abstract 4997: Specialized microRNP and translation mechanisms in quiescent cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Quiescence (G0) represents an assortment of reversible, cell cycle-arrested states that are resistant to unfavorable conditions and associated with cancer persistence. G0 involves regulated gene expression with selective mRNA expression and decreased canonical translation. Low mTOR activity in G0 activates the cap complex inhibitor, eIF4EBP, and impairs canonical translation. The alternative translation mechanisms in G0 remain to be uncovered. Our data show that microRNAs, regulatory, non-coding RNAs that target distinct mRNAs to alter gene expression, can associate with alternative complexes and translation factors to regulate specific mRNA translation in G0. One subset of transcripts expressed in G0 includes specific mRNAs recruited by an FXR1a-associated microRNP (microRNA-protein complex) for translation activation in G0 mammalian cells. MicroRNPs predominantly mediate repression and downregulation; however, FXR1a-microRNP lacks conventional microRNP repressors, and instead, contains a specific RNA binding protein isoform, FXR1a. FXR1a promotes translation and is overexpressed and associated with poor prognosis in several cancers. Our data reveal that microRNA-mediated activation requires target mRNAs with unadenylated/ shortened poly(A) tails to avoid the roles of PABP in enhancing microRNA-mediated downregulation and in canonical translation that is impaired in G0. Instead of canonical translation factors that are inhibited by eIF4EBP in G0, we find alternative translation factors—a non-canonical 5’cap binding factor and an eIF4G homolog that interacts with the ribosome—are recruited by the 3’-UTR binding FXR1a-microRNP, and promote specific mRNA translation. Our data show that G0 leukemic cells are chemoresistant and their translation profile is similar to surviving leukemic cells that are isolated after clinical therapy. We find expression of critical cytokines and immune regulators in G0. Significantly, inhibiting these immune regulators in resistant G0 cancer cells reduces their survival and chemoresistance. These data reveal a specialized translation mechanism in G0 cancer cells that promotes specific mRNA translation in these conditions of reduced canonical translation, and is important for chemoresistance. Citation Format: Syed I. Bukhari, Samuel S. Truesdell, Sooncheol Lee, Swapna Kollu, Anthony Classon, Myriam Boukhali, Esha Jain, Richard D. Mortensen, Akiko Yanagiya, Ruslan Sadreyev, Wilhelm Haas, Shobha Vasudevan. Specialized microRNP and translation mechanisms in quiescent cancer cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 4997. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-4997
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».