MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2741791382 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-3162

Abstract 3162: HRAS G12V predicts for innate resistance to PI3Kα inhibition in head and neck squamous cell cancer

2017· article· en· W2741791382 sur OpenAlexaff
Kara M. Ruicci, Ren Sun, Morgan Black, Nicole Pinto, John Yoo, Kevin Fung, Danielle MacNeil, Lauire Aillies, Joseph S. Mymryk, Paul C. Boutros, John W. Barrett, Anthony C. Nichols

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHRASPI3K/AKT/mTOR pathwayCancer researchHead and neck squamous-cell carcinomaMedicineCancerBiologyInternal medicineHead and neck cancerKRASGeneticsSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the sixth most common cancer worldwide, with an incidence of ~600 000 new cases per year and a 50% mortality rate for advanced disease. The mutational landscape of HNSCC has been recently elucidated, introducing the possibility for targeted therapeutic approaches. PIK3CA—which encodes the α-catalytic subunit of PI3K (PI3Kα)—is the most frequently altered actionable target in HNSCC, however it is not presently clear which patients benefit most from PI3Kα-inhibition. BYL719 is a leading PI3Kα inhibitor in clinical development for HNSCC. We previously examined the responses of a large panel of genetically-characterized HNSCC cell lines to BYL719 and identified activating HRAS G12V mutations as strong predictors for BYL719 resistance. Here we examine if this mutation is able to individually modulate BYL719 response through overexpression and knockdown studies. Methods: To determine if HRAS G12V was able to modulate BYL719 sensitivity, we knocked down HRAS in HRAS G12V and HRAS wild-type (WT) cell lines using RNA interference, and then treated cells over 10-point dose ranges with BYL719. Sensitivity was determined by calculating IC50 (half-maximal inhibitory concentration) values at 72 hours using PrestoBlue®. Constructs expressing wildtype (WT) HRAS or HRAS G12V were transfected into BYL719-sensitive cells for overexpression studies and cells were selected using G418 Sulfate for 1 month. Proliferation and BYL719 sensitivity (IC50 values) were measured as described. Immunoblotting was used to examine activity of the PI3K-AKT axis with and without BYL719 (1μM) for 24 hours. Results & Conclusions: HRAS knockdown sensitized HRAS G12V lines to BYL719 (lower IC50), but did not affect the response of WT HRAS cells. WT HRAS and HRAS G12V overexpression significantly increased cellular proliferation and promoted BYL719 resistance. In HRAS G12V cell lines, we observed high levels of active phosphorylated AKT (S473/T308), even in the presence of BYL719. Collectively these findings highlight the predictive role of HRAS G12V for innate BYL719 resistance and contribute to our understanding of which patients may respond best on BYL719 therapy. Citation Format: Kara M. Ruicci, Ren Sun, Morgan Black, Nicole Pinto, John Yoo, Kevin Fung, Danielle Macneil, Lauire Aillies, Joseph S. Mymryk, Paul C. Boutros, John W. Barrett, Anthony C. Nichols. HRAS G12V predicts for innate resistance to PI3Kα inhibition in head and neck squamous cell cancer [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 3162. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-3162

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetRNA modifications and cancer→Travaux en français237 207→