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Enregistrement W2741923037 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-2479

Abstract 2479: A functionally null <i>RAD51D</i> missense mutation is strongly associated with ovarian carcinoma

2017· article· en· W2741923037 sur OpenAlexaffabout
Bárbara Rivera, Massimo Di Iorio, Jessica Frankum, Javad Nadaf, Somayyeh Fahiminiya, Suzanna L. Arcand, David L. Burk, Damien Grapton, Eva Tomiak, Valerie Hastings, Nancy Hamel, Rabea Wagener, Olga Aleynikova, Sylvie Giroux, Fadi F. Hamdan, Alexandre Orthwein, George Zogopoulos, François Rousseau, Albert M. Berghuis, Diane Provencher, Guy A. Rouleau, Jacques L. Michaud, Anne‐Marie Mes‐Masson, Jacek Majewski, Susanne Bens, Reiner Siebert, Steven A. Narod, Mohammad Esmaeil Akbari, Chris Lord, Patricia N. Tonin, Alexandre Dionne‐Laporte, William D. Foulkes

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensPublic Health OntarioMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineCentre hospitalier de l'Université LavalJewish General HospitalUniversity of OttawaMcGill University Health CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchOvarian cancerGeneticsMissense mutationCancerMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background and goal: RAD51D is a key player in DNA repair by homologous recombination (HR) and carriers of truncating RAD51D mutations have an increased risk for ovarian cancer (OC). However, the contribution of non-truncating RAD51D variants to cancer predisposition remains uncertain. We sought to fully characterize the previously described missense RAD51D variant c.620C>T;p.S207L in order to elucidate its role in OC. Methods: A clinical panel screening was used to identify the RAD51D variant c.620C>T;p.S207L in two French Canadian (FC) kindred affected with familial High Grade Serous Cancer (HGSC) of the ovary or endometrium. High resolution melting, TaqMan genotyping and Sanger sequencing were used to genotype the p.S207L variant in a series of unselected cases of HGSC of the ovary and endometrium, breast, pancreas and colorectal cancer and healthy controls, all of a FC origin. Whole exome sequencing (WES) was performed to study the genetic signature characterizing RAD51D associated tumors. RAD51 foci formation and CRISPR-Cas9-stimulated and HR-mediated gene targeting assays were used to assess HR activity of RAD51D-S207L mutated CHO cells. HR activity in RAD51D-S207L mutated human cells was tested by a DR-GFP assay. The effect of RAD51D p.S207L on RAD51D-XRCC2 interactions was analyzed by co-immunoprecipitation and quantified in-vivo in a single cell colocalization assay. Sensitivity to PARP inhibitors (PARPi) was evaluated in a cell survival assay. Results: Using deep sequencing and case-control genotyping studies, we showed that the missense RAD51D variant c.620C>T;p.S207L is over-represented in the French Canadian population affected by HGSC of the ovary (3.8% cases vs 0.002% controls; p < 0.0001).The frequency of the p.S207L variant did not differ from that of controls in breast, endometrial, pancreas and colorectal adenocarcinomas. A common haplotype shared by all the carriers suggested a founder origin for c.620C>T;p.S207L mutation. WES analysis of RAD51D tumor profiles revealed the presence of signature 3 which is known to be associated with HR defects. Functionally, we show that this mutation impairs HR by disrupting the RAD51D-XRCC2 interaction and confers PARP-inhibitor sensitivity to CHO cells. Conclusions: This work identifies RAD51D p.S207L as the first bona fide pathogenic missense susceptibility allele for HGSC of the ovary and supports the use of targeted PARPi therapies in OC patients carrying missense RAD51D mutations. Citation Format: Barbara Rivera, Massimo R. Di Iorio, Jessica Frankum, Javad Nadaf, Somayyeh Fahiminiya, Suzanna L. Arcand, David Burk, Damien Grapton, Eva Tomiak, Valerie Hastings, Nancy Hamel, Rabea Wagener, Olga Aleynikova, Sylvie Giroux, Fadi F. Hamdan, Alexandre Orthwein, George Zogopoulos, Francois Rousseau, Albert Berghuis, Diane M. Provencher, Guy A. Rouleau, Jacques L. Michaud, Anne-Marie Mes-Masson, Jacek Majewski, Susanne Bens, Reiner Siebert, Steven Narod, Mohammad Akbari, Chris J. Lord, Patricia N. Tonin, Alexandre Dionne-Laporte, William D. Foulkes. A functionally null RAD51D missense mutation is strongly associated with ovarian carcinoma [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 2479. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-2479

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
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