MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2742024316 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-4510

Abstract 4510: ADP- dependent glucokinase controls hypoxic gradients, <i>ex vivo</i> avascular and <i>in vivo</i> tumor growth through modulation of HIF-1α/mTOR signaling

2017· article· en· W2742024316 sur OpenAlexaff
Sergio Rey, Luana Schito, Marianne Koritzinsky, Bradly G. Wouters

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene knockdownBiologyEx vivoHIF1ATransactivationTumor progressionCancer researchGlucokinaseIn vivoTumor microenvironmentPI3K/AKT/mTOR pathwayCancer cellCell biologyMolecular biologyTranscription factorCancerSignal transductionGeneAngiogenesisBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract ADP- dependent glucokinase (ADPGK) is an evolutionarily conserved archaeal glycolytic enzyme frequently upregulated in human cancers whose role remains elusive. We have recently discovered that ADPGK contributes to ROS- dependent stabilization of hypoxia- inducible factor (HIF)-1α (and -2α) and hypoxic target gene transactivation in cancer cells. Hereby, we deconvolute the effect of ADPGK loss-of-function (LoF) upon the 3D hypoxic tumor microenvironment, a crucial pathobiological aspect determining therapeutic responses in cancer patients. ADPGK, HIF-1α and HIF-2α LoF was attained through shRNA- mediated knockdown (>75%) in HCT-116 colon cancer cells. HIF-1α (and -2α) transcriptional activity was measured through RT-qPCR arrays whereas protein levels were assessed by immunoblot. O2 and glucose consumption were measured in 2D with a real-time bioanalyzer (Seahorse). Avascular 3D spheroids and xenografts were used to measure the effect of ADPGK LoF upon tumor growth. Hypoxic gradients in 3D tumor spheroids were quantified using the O2- sensitive nitroimidazole probe EF5 in combination with confocal microscopy and 3D image reconstruction. RT-qPCR arrays identified a core group of 11 hypoxia- inducible transcripts dependent upon ADPGK expression (CA9, DDIT4, ERO1L, Igfbp3, Scl2a3, Bhlhe40, Bnip3L, Egln1, Fam162a, Pgk1 and PKM), henceforth referred to as ‘ADPGK- dependent HIF-α target signature’ (ADHTS). Comparison of ADHTS transcriptional profiles with HIF-1α or -2α deficient cells showed that ADPGK LoF is not selective for either HIF-α paralog. Since ADHTS contained genes critical for mTOR signaling, glycolytic activity and mitochondrial autophagy, we performed metabolic profiling and found that ADPGK LoF increased O2 consumption in a rapamycin- sensitive manner whilst increasing mitochondrial mass. Moreover, ADPGK LoF enhanced xenograft growth and vascularization associated with decreased protein levels of HIF-2α and the negative mTOR regulator DDIT4. In avascular 3D spheroids, ADPGK LoF increased growth, intra-spheroidal hypoxia and caused steeper hypoxic gradients in parallel to enhanced mTOR→pS6K→p4EBP1 signaling. RNAseq data from colon adenocarcinoma patients (TCGA; n= 382) confirmed that ADPGK expression correlates with ADHTS, HIF-α target gene expression, hypoxia scores and decreased overall survival. Consistent with our preclinical findings, the ADHTS gene signature inversely correlated with an mTOR gene signature in the same dataset. Our results uncover a hitherto unknown function of ADPGK as a crucial determinant of the degree and distribution of hypoxia within the tumor microenvironment through modulation of HIF-1α→mTOR signaling. Our analysis of TCGA data supports these preclinical findings thereby suggesting that ADPGK is a suitable therapeutic target in patients bearing hypoxic cancers. Citation Format: Sergio Rey, Luana Schito, Marianne Koritzinsky, Bradly G. Wouters. ADP- dependent glucokinase controls hypoxic gradients, ex vivo avascular and in vivo tumor growth through modulation of HIF-1α/mTOR signaling [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 4510. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-4510

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Research→Même sujetCancer, Hypoxia, and Metabolism→Travaux en français237 207→