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Enregistrement W2742630678 · doi:10.1136/sextrans-2017-053264.456

P3.221 High levels of susceptibility in<i>neisseria gonorrhoeae</i>isolates from saskatchewan canada (2003–2015) to new and older antibiotics used for treatment

2017· article· en· W2742630678 sur OpenAlexaffabout
SD Thakur, P N Levett, Gregory Horsman, JR Dillon

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensSaskatchewan Disease Control LaboratoryUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCefiximeNeisseria gonorrhoeaePenicillinMedicineAntibioticsMicrobiologyCiprofloxacinSpectinomycinAzithromycinAntibiotic resistanceAgar dilutionCeftriaxoneTetracyclineBiologyMinimum inhibitory concentration

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Antibiotics should have an efficacy of at least 95% for treating infections caused by Neisseria gonorrhoeae (Ng). When more than 5% of Ng isolates are resistant to an antibiotic, treatment guidelines must be changed to a more effective antibiotic. Trends in the antimicrobial susceptibility (AMS) of Ng isolates from Saskatchewan, Canada were ascertained (2003 – 2015) to ascertain whether older antimicrobials might be effective. Methods The susceptibility of 685 Ng isolates to 7 antibiotics was determined by the agar dilution method. β-lactamase production was determined using nitrocefin. Results From 2006–2012, penicillin resistance was below 5% (0%–4.0%) of Ng isolates tested. Penicillin resistance above 5% occurred in 2003 (6.7%), 2004 (6.8%), 2005 (11.5%), 2013 (27.5%) and 2014 (13.5%). Tetracycline resistance remained above 5% (11.8% to 89.1%) of Ng tested throughout the study. Ciprofloxacin resistance ranged between 0% and 1.9% of isolates tested up to 2009 but was over 5% thereafter. All isolates were susceptible to spectinomycin. Over 95% of Ng isolates tested were susceptible to azithromycin except in 2010 (27.6% resistant; 8/29) and 2013 (7.2% resistant; 5/69). Twelve (1.8%) isolates over the period showed reduced susceptibility to cefixime (2006 - 1/55; 2012 - 2/50; 2013 - 4/69; 2014 - 2/89; 2015 - 1/63) and/or ceftriaxone (2012 - 2/50). One isolate was resistant to both azithromycin and cefixime. Conclusions Cases of gonorrhoea in Saskatchewan (>95%) are diagnosed by nucleic acid testing with no AMS testing. Our research showed that many no-longer recommended antibiotics (penicillin, ciprofloxacin) were still effective over many years. Even with the recent higher percentages of Ng isolates resistant to penicillin and ciprofloxacin, ~87% of Ng in the province remains susceptible to these antibiotics. The development of NAATs to test for AMS would enhance knowledge of true levels of resistance and allow discretion as to whether older but still effective antibiotics could be used in individual patient care.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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