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Enregistrement W2743277997 · doi:10.1101/173062

Genome-wide association study identifies 30 Loci Associated with Bipolar Disorder

2017· preprint· en· W2743277997 sur OpenAlexafffund
Eli A. Stahl, Gerome Breen, Andreas J. Forstner, Andrew McQuillin, Stephan Ripke, Vassily Trubetskoy, Manuel Mattheisen, Yunpeng Wang, Jonathan R. I. Coleman, Helena Gaspar, Christiaan de Leeuw, Stacy Steinberg, Jennifer M. Whitehead Pavlides, Maciej Trzaskowski, Tune H. Pers, Peter Holmans, Liam Abbott, Esben Agerbo, Huda Akil, Diego Albani, Ney Alliey‐Rodriguez, Thomas D. Als, Adebayo Anjorin, Verneri Antilla, Swapnil Awasthi, Judith A. Badner, Marie Bækvad‐Hansen, Jack D. Barchas, Nicholas Bass, Michael Bauer, Richard A. Belliveau, Sarah E. Bergen, Carsten Bøcker Pedersen, Erlend Bøen, Marco P. Boks, James Boocock, Monika Budde, William E. Bunney, Margit Burmeister, Jonas Bybjerg‐Grauholm, William Byerley, Miguel Casas, Felecia Cerrato, Pablo Cervantes, Kimberly Chambert, Alexander W. Charney, Danfeng Chen, Claire Churchhouse, Toni‐Kim Clarke, William Coryell, David W. Craig, Cristiana Cruceanu, David Curtis, Piotr M. Czerski, Anders M. Dale, Simone de Jong, Franziska Degenhardt, Jurgen Del‐Favero, J. Raymond DePaulo, Srdjan Djurovic, Amanda Dobbyn, Ashley Dumont, Torbjørn Elvsåshagen, Valentina Escott‐Price, Chun Chieh Fan, Sascha B. Fischer, Matthew Flickinger, Tatiana Foroud, Liz Forty, Josef Frank, Christine Fraser, Louise Frisén, Katrin Gade, Diane Gage, Julie Garnham, Claudia Giambartolomei, Marianne Giørtz Pedersen, Jaqueline Goldstein, Scott D. Gordon, Katherine Gordon‐Smith, Elaine Green, Melissa J. Green, Tiffany A. Greenwood, Jakob Grove, Weihua Guan, JoséGuzman Parra, Marian L. Hamshere, Martin Hautzinger, Urs Heilbronner, Stefan Herms, Maria Hipolito, Per Hoffmann, Dominic Holland, Laura M. Huckins, Stéphane Jamain, Jessica Johnson, Anders Juréus, Radhika Kandaswamy, Robert Karlsson, James L. Kennedy, Sarah Kittel‐Schneider, Sarah Knott, James A. Knowles, Manolis Kogevinas, Anna C. Koller, Ralph Kupka, Catharina Lavebratt, Jacob Lawrence, William Lawson, Markus Leber, Phil H. Lee, Shawn Levy, Jun Z. Li, Chunyu Liu, Susanne Lucae, Anna Maaser, Donald J. MacIntyre, Pamela B. Mahon, Wolfgang Maier, Lina Martinsson, Steve McCarroll, Peter McGuffin, Melvin G. McInnis, James McKay, Helena Medeiros, Sarah E. Medland, Fan Meng, Lili Milani, Grant W. Montgomery, Derek W. Morris, Thomas W. Mühleisen, Niamh Mullins, Hoang Nguyen, Caroline M. Nievergelt, Annelie Nordin Adolfsson, Evaristus Nwulia, Claire O’Donovan, Loes M. Olde Loohuis, Anil P. S. Ori, Lilijana Oruč, Urban Ösby, Roy H. Perlis, Amy Perry, Andrea Pfennig, James B. Potash, Shaun Purcell, Eline J. Regeer, Andreas Reif, Céline S. Reinbold, John P. Rice, Fabio Rivas, Margarita Rivera, Panos Roussos, Douglas M. Ruderfer, Euijung Ryu, Cristina Sánchez‐Mora, Alan F. Schatzberg, William A. Scheftner, Nicholas J. Schork, Cynthia Shannon Weickert, Tatyana Shehktman, Paul D. Shilling, Engilbert Sigurðsson, Claire Slaney, Olav B. Smeland, Janet L. Sobell, Christine Søholm Hansen, Anne T. Spijker, David St Clair, Michael Steffens, John S. Strauss, Fabian Streit, Jana Strohmaier, Szabolcs Szelinger, Robert C. Thompson, Thorgeir E. Thorgeirsson, Jens Treutlein, Helmut Vedder, Weiqing Wang, Stanley J. Watson, Thomas W. Weickert, Stephanie H. Witt, Simon Xi, Wei Xu, Allan H. Young, Peter P. Zandi, Peng Zhang, Sebastian Zöllner, Rolf Adolfsson, Ingrid Agartz, Martin Alda, Lena Backlund, Bernhard T. Baune, Frank Bellivier, Wade H. Berrettini, Joanna M. Biernacka, Douglas Blackwood, Michael Boehnke, Anders D. Børglum, Aiden Corvin, Nicholas Craddock, Mark J. Daly, Udo Dannlowski, Tõnu Esko, Bruno Étain, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Elliot S. Gershon, Michael Gill, Fernando S. Goes, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Joanna Hauser, David M. Hougaard, Christina M. Hultman, Ian Jones, Lisa Jones, RenéS Kahn, George Kirov, Mikael Landén, Marion Leboyer, Cathryn M. Lewis, Qingqin S. Li, Jolanta Lissowska, Nicholas G. Martin, Fermín Mayoral, Susan L. McElroy, Andrew M. McIntosh, Francis J. McMahon, Ingrid Melle, Andres Metspalu, Philip B. Mitchell, Gunnar Morken, Ole Mors, Preben Bo Mortensen, Bertram Müller-Myhsok, R Myers, Benjamin M. Neale, Vishwajit L. Nimgaonkar, Merete Nordentoft, Markus M. Nöthen, Michael O‘Donovan, Ketil J. Øedegaard, Michael J. Owen, Sara A. Paciga, Carlos N. Pato, Michele T. Pato, Daniëlle Posthuma, Josep Antoni Ramos‐Quiroga, Marta Ribasés, Marcella Rietschel, Guy A. Rouleau, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Thomas G. Schulze, Alessandro Serretti, Jordan W. Smoller, Hreinn Stefánsson, Eystein Stordal, Patrick F. Sullivan, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, John B. Vincent, Thomas Werge, John I. Nürnberger, Naomi R. Wray, Arianna Di Florio, Howard J. Edenberg, Sven Cichon, Roel A. Ophoff, Laura J. Scott, Ole A. Andreassen, John R. Kelsoe, Pamela Sklar

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoAmgen (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilNational Institutes of HealthVictoria General Hospital FoundationCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalUniversità di BolognaEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionMichael Smith Health Research BCUniversitat de BarcelonaWellcome Trust
Mots-clésBipolar disorderManiaGenome-wide association studySchizophrenia (object-oriented programming)Major depressive disorderGenetic associationGeneticsPsychiatryMedicinePsychologyBiologyGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotypeLithium (medication)Mood

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Bipolar disorder is a highly heritable psychiatric disorder that features episodes of mania and depression. We performed the largest genome-wide association study to date, including 20,352 cases and 31,358 controls of European descent, with follow-up analysis of 822 sentinel variants at loci with P<1×10 -4 in an independent sample of 9,412 cases and 137,760 controls. In the combined analysis, 30 loci reached genome-wide significant evidence for association, of which 20 were novel. These significant loci contain genes encoding ion channels and neurotransmitter transporters ( CACNA1C , GRIN2A , SCN2A , SLC4A1 ), synaptic components ( RIMS1 , ANK3 ), immune and energy metabolism components. Bipolar disorder type I (depressive and manic episodes; ~ 73% of our cases) is strongly genetically correlated with schizophrenia whereas bipolar disorder type II (depressive and hypomanic episodes; ~ 17% of our cases) is more strongly correlated with major depressive disorder. These findings address key clinical questions and provide potential new biological mechanisms for bipolar disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations255
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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