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Enregistrement W2743390842 · doi:10.1097/pas.0000000000000838

Eosinophilic Solid and Cystic Renal Cell Carcinoma (ESC RCC)

2017· article· en· W2743390842 sur OpenAlexaff
Kiril Trpkov, Hatem Abou–Ouf, Ondřej Hes, José I. López, Gabriella Nesi, Éva Compérat, Mathilde Sibony, Adeboye O. Osunkoya, Ming Zhou, Neriman Gökden, Xavier Leroy, Daniel M. Berney, Isabela Werneck da Cunha, M. Musto, Daniel Abensur Athanazio, Aslı Yilmaz, Bryan Donnelly, Eric Hyndman, Anthony J. Gill, Jesse K. McKenney, Tarek A. Bismar

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberous Sclerosis Complex Research
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTuberous sclerosisRenal cell carcinomaEosinophilicPathologyMedicineClear cellKaryotypeNephrectomyKidneyInternal medicineBiologyChromosomeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eosinophilic solid and cystic renal cell carcinoma (ESC RCC) has been recently described as a unique and indolent renal neoplasm, found in female patients with and without tuberous sclerosis complex. Although ESC RCC has a distinct morphology and frequent CK20 reactivity, its molecular karyotype has been previously studied only in few cases. We identified 19 ESC RCC from multiple institutions; all patients were female individuals without clinical features of tuberous sclerosis complex. Molecular karyotyping was performed in 13 cases (12 with informative result). The median age was 55 years (range: 32 to 79 y). The tumors were yellow-gray with a median size of 31 mm (range: 12 to 135 mm) and showed solid and cystic gross appearance. All tumors demonstrated typical microscopic features with solid areas admixed with variably sized macrocysts and microcysts. The cells showed eosinophilic cytoplasm with granular cytoplasmic stippling and round-to-oval nuclei. CK20 was positive in 14/19 (74%) cases. Stage pT1 was found in 17/19 (89%) patients (pT1a in 12, pT1b in 5); 1 patient each had pT2a and pT3a. A total of 15/16 patients with available follow-up were alive and without evidence of disease progression, after 1 to 169 months (median: 44 mo; mean: 49.6 mo); 3 died of other causes. The most common copy number gains were 16p13.3-16q23.1 (33% to 67%), 7p21.2-7q36.2 (42% to 50%), 13q14.2 (33%), and 19p12 (33%). The most common copy number losses included Xp11.21 (42%) and 22q11.23 (33%). Loss of heterozygosity was most frequently found at 16p11.2-11.1 (75%), Xq11.1-13.1 (75%), Xq13.1-21.1 (33%), 11p11.2-11.11 (33%), 9q21.1-22.2 (33%), and 9q33.1 (33%). ESC RCC demonstrates common molecular karyotype alterations, which further support its distinct nature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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