The Lipid Kinase PIKfyve Coordinates the Neutrophil Immune Response through the Activation of the Rac GTPase
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Neutrophils rapidly arrive at an infection site because of their unparalleled chemotactic ability, after which they unleash numerous attacks on pathogens through degranulation and reactive oxygen species (ROS) production, as well as by phagocytosis, which sequesters pathogens within phagosomes. Phagosomes then fuse with lysosomes and granules to kill the enclosed pathogens. A complex signaling network composed of kinases, GTPases, and lipids, such as phosphoinositides, helps to coordinate all of these processes. There are seven species of phosphoinositides that are interconverted by lipid kinases and phosphatases. PIKfyve is a lipid kinase that generates phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate and, directly or indirectly, phosphatidylinositol-5-phosphate [PtdIns(5)P]. PIKfyve inactivation causes massive lysosome swelling, disrupts membrane recycling, and, in macrophages, blocks phagosome maturation. In this study, we explored for the first time, to our knowledge, the role of PIKfyve in human and mouse neutrophils. We show that PIKfyve inhibition in neutrophils does not affect granule morphology or degranulation, but it causes LAMP1+ lysosomes to engorge. Additionally, PIKfyve inactivation blocks phagosome–lysosome fusion in a manner that can be rescued, in part, with Ca2+ ionophores or agonists of TRPML1, a lysosomal Ca2+ channel. Strikingly, PIKfyve is necessary for chemotaxis, ROS production, and stimulation of the Rac GTPases, which control chemotaxis and ROS. This is consistent with observations in nonleukocytes that showed that PIKfyve and PtdIns(5)P control Rac and cell migration. Overall, we demonstrate that PIKfyve has a robust role in neutrophils and propose a model in which PIKfyve modulates phagosome maturation through phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate–dependent activation of TRPML1, whereas chemotaxis and ROS are regulated by PtdIns(5)P-dependent activation of Rac.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».