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Enregistrement W2743752097 · doi:10.4049/jimmunol.1601466

The Lipid Kinase PIKfyve Coordinates the Neutrophil Immune Response through the Activation of the Rac GTPase

2017· article· en· W2743752097 sur OpenAlexafffund
Roya M. Dayam, Chun Xiang Sun, Christopher H. Choy, Gemma Mancuso, Michael Glogauer, Roberto J. Botelho

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalcium signaling and nucleotide metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPhagosomeCell biologyBiologyPhosphatidylinositolDegranulationKinaseGTPaseChemotaxisPhagocytosisBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neutrophils rapidly arrive at an infection site because of their unparalleled chemotactic ability, after which they unleash numerous attacks on pathogens through degranulation and reactive oxygen species (ROS) production, as well as by phagocytosis, which sequesters pathogens within phagosomes. Phagosomes then fuse with lysosomes and granules to kill the enclosed pathogens. A complex signaling network composed of kinases, GTPases, and lipids, such as phosphoinositides, helps to coordinate all of these processes. There are seven species of phosphoinositides that are interconverted by lipid kinases and phosphatases. PIKfyve is a lipid kinase that generates phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate and, directly or indirectly, phosphatidylinositol-5-phosphate [PtdIns(5)P]. PIKfyve inactivation causes massive lysosome swelling, disrupts membrane recycling, and, in macrophages, blocks phagosome maturation. In this study, we explored for the first time, to our knowledge, the role of PIKfyve in human and mouse neutrophils. We show that PIKfyve inhibition in neutrophils does not affect granule morphology or degranulation, but it causes LAMP1+ lysosomes to engorge. Additionally, PIKfyve inactivation blocks phagosome–lysosome fusion in a manner that can be rescued, in part, with Ca2+ ionophores or agonists of TRPML1, a lysosomal Ca2+ channel. Strikingly, PIKfyve is necessary for chemotaxis, ROS production, and stimulation of the Rac GTPases, which control chemotaxis and ROS. This is consistent with observations in nonleukocytes that showed that PIKfyve and PtdIns(5)P control Rac and cell migration. Overall, we demonstrate that PIKfyve has a robust role in neutrophils and propose a model in which PIKfyve modulates phagosome maturation through phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate–dependent activation of TRPML1, whereas chemotaxis and ROS are regulated by PtdIns(5)P-dependent activation of Rac.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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