MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2743921188 · doi:10.1016/j.celrep.2017.06.008

Integrative Genomic Analysis of Cholangiocarcinoma Identifies Distinct IDH-Mutant Molecular Profiles

2017· erratum· en· W2743921188 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2017
Typeerratum
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholangiocarcinoma and Gallbladder Cancer Studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Cancer AgencyUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Human Genome Research InstituteNovo Nordisk FondenCholangiocarcinoma Foundation
Mots-clésIntrahepatic CholangiocarcinomaBiologyComputational biologyEpigeneticsMutantGeneticsATRXGeneBioinformaticsMutationMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cholangiocarcinoma (CCA) is an aggressive malignancy of the bile ducts,\nwith poor prognosis and limited treatment options. Here, we describe the\nintegrated analysis of somatic mutations, RNA expression, copy number, and DNA\nmethylation by The Cancer Genome Atlas, of a set of predominantly intrahepatic\nCCA cases, and propose a molecular classification scheme. We identified an\nIDH-mutant enriched subtype with distinct molecular\nfeatures including low expression of chromatin modifiers, elevated expression of\nmitochondrial genes, and increased mitochondrial DNA copy number. Leveraging the\nmulti-platform data, we observed that ARID1A exhibited DNA hypermethylation and\ndecreased expression in the IDH-mutant subtype. More broadly,\nwe found that IDH mutations are associated with an expanded\nhistological spectrum of liver tumors with molecular features that stratify with\nCCA. Our studies reveal insights into the molecular pathogenesis and\nheterogeneity of cholangiocarcinoma and provide classification information of\npotential therapeutic significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,608
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle