Integrative Genomic Analysis of Cholangiocarcinoma Identifies Distinct IDH-Mutant Molecular Profiles
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Cholangiocarcinoma (CCA) is an aggressive malignancy of the bile ducts,\nwith poor prognosis and limited treatment options. Here, we describe the\nintegrated analysis of somatic mutations, RNA expression, copy number, and DNA\nmethylation by The Cancer Genome Atlas, of a set of predominantly intrahepatic\nCCA cases, and propose a molecular classification scheme. We identified an\nIDH-mutant enriched subtype with distinct molecular\nfeatures including low expression of chromatin modifiers, elevated expression of\nmitochondrial genes, and increased mitochondrial DNA copy number. Leveraging the\nmulti-platform data, we observed that ARID1A exhibited DNA hypermethylation and\ndecreased expression in the IDH-mutant subtype. More broadly,\nwe found that IDH mutations are associated with an expanded\nhistological spectrum of liver tumors with molecular features that stratify with\nCCA. Our studies reveal insights into the molecular pathogenesis and\nheterogeneity of cholangiocarcinoma and provide classification information of\npotential therapeutic significance.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle