Four <scp>PTEN</scp>‐targeting co‐expressed mi<scp>RNA</scp>s and <scp>ACTN</scp>4‐ targeting mi<scp>R</scp>‐548b are independent prognostic biomarkers in human squamous cell carcinoma of the oral tongue
Notice bibliographique
Résumé
The purpose of this study was to determine the prognostic value and oncogenic pathways associated to miRNA expression in squamous cell carcinoma of the oral tongue and to link these miRNA candidates with potential gene targets. We performed a miRNA screening within our institutional cohort (n = 58 patients) and reported five prognostic targets including a cluster of four co-expressed miRNAs (miR-18a, miR-92a, miR-103, and miR-205). Multivariate analysis showed that expression of miR-548b (p = 0.007) and miR-18a (p = 0.004, representative of co-expressed miRNAs) are independent prognostic markers for squamous cell carcinoma of the oral tongue. These findings were validated in The Cancer Genome Atlas (TCGA) cohort (n = 131) for both miRNAs (miR-548b: p = 0.027; miR-18a: p = 0.001). Bioinformatics analysis identified PTEN and ACTN4 as direct targets of the four co-expressed miRNAs and miR-548b, respectively. Correlations between the five identified miRNAs and their respective targeted genes were validated in the two merged cohorts and were concordantly significant (miR-18a/PTEN: p < 0.0001; miR-92a/PTEN: p = 0.0008; miR-103/PTEN: p = 0.008; miR-203/PTEN: p = 0.019; miR-548b/ACTN4: p = 0.009).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».