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Enregistrement W2744736570 · doi:10.1104/pp.17.00611

A Conifer UDP-Sugar Dependent Glycosyltransferase Contributes to Acetophenone Metabolism and Defense against Insects

2017· article· en· W2744736570 sur OpenAlexafffund
Melissa H. Magerøy, Sharon Jancsik, Macaire M. S. Yuen, Michael B. Fischer, Stephen G. Withers, Christian Paetz, Bernd Schneider, John Mackay, Jöerg Bohlmann

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversité LavalCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyGlycosideSpruce budwormBotanyGlycosyltransferaseBiochemistryMetaboliteBeta-glucosidaseGlycosylationShootSugarMetabolismEnzymePEST analysisTortricidaeEnzyme assay

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acetophenones are phenolic compounds involved in the resistance of white spruce (Picea glauca) against spruce budworm (Choristoneura fumiferiana), a major forest pest in North America. The acetophenones pungenol and piceol commonly accumulate in spruce foliage in the form of the corresponding glycosides, pungenin and picein. These glycosides appear to be inactive against the insect but can be cleaved by a spruce β-glucosidase, PgβGLU-1, which releases the active aglycons. The reverse glycosylation reaction was hypothesized to involve a family 1 UDP-sugar dependent glycosyltransferase (UGT) to facilitate acetophenone accumulation in the plant. Metabolite and transcriptome profiling over a developmental time course of white spruce bud burst and shoot growth revealed two UGTs, PgUGT5 and PgUGT5b, that glycosylate pungenol. Recombinant PgUGT5b enzyme produced mostly pungenin, while PgUGT5 produced mostly isopungenin. Both UGTs also were active in vitro on select flavonoids. However, the context of transcript and metabolite accumulation did not support a biological role in flavonoid metabolism but correlated with the formation of pungenin in growing shoots. Transcript levels of PgUGT5b were higher than those of PgUGT5 in needles across different genotypes of white spruce. These results support a role of PgUGT5b in the biosynthesis of the glycosylated acetophenone pungenin in white spruce.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,954

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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