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Enregistrement W2744750719 · doi:10.1039/c7an00161d

A broader view on ion heating in traveling-wave devices using fragmentation of CsI clusters and extent of H˙ migration as molecular thermometers

2017· article· en· W2744750719 sur OpenAlexaff
Frederik Lermyte, Frank Sobott

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesVlaamse regeringVlaamse Instelling voor Technologisch OnderzoekFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésFragmentation (computing)IonTraveling waveMaterials scienceAnalytical Chemistry (journal)Engineering physicsChemistryPhysicsComputer scienceEnvironmental chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Electron transfer dissociation (ETD) is becoming increasingly important in mass spectrometry-based analysis of peptides and proteins. Supplemental collisional activation of undissociated electron transfer products can significantly increase fragmentation yield and sequence coverage, but hydrogen rearrangements - specifically, transfer of a hydrogen radical from a c to a z fragment - lead to distorted isotope distributions and increased potential for signal overlap. Concomitant collisional activation during the ion/ion reaction significantly reduces these rearrangements, but, in ion traps, also leads to lower reaction rates and reduced overlap of anion and cation clouds. In traveling-wave ion mobility devices, it has been reported - although not under ETD conditions - that significant ion activation can occur depending on the T-wave height and velocity. Here, we investigate this phenomenon in more detail using a commercial instrument (Waters Synapt G2) and report that a similar effect can be induced within the traveling-wave Trap cell where the ETD reaction occurs, using fairly typical T-wave settings. This ion 'heating' is demonstrated by analyzing the observed isotope distributions (sensitive to the aforementioned hydrogen rearrangements) of ETD fragments of ubiquitin and substance P. A more detailed investigation of ion activation using cesium iodide clusters (without ETD reagent anions present) shows that the observed behavior is consistent with the known dynamics of ions within traveling-wave devices. The insights gained in this work are potentially relevant both for 'native ETD' studies (in which tuning needs to be optimized to avoid unintentional ion activation) as well as the design of future T-wave ETD devices (where this 'heating' effect might be exploited to promote fragment release).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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