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Enregistrement W2745045632 · doi:10.1136/jmedgenet-2017-104542

Association between the Lynch syndrome gene MSH2 and breast cancer susceptibility in a Canadian familial cancer registry

2017· article· en· W2745045632 sur OpenAlexaffabout
Mira Goldberg, Kathleen Bell, Melyssa Aronson, Kara Semotiuk, Gregory R. Pond, Steven Gallinger, Kevin Zbuk

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensToronto General HospitalMcMaster UniversityMount Sinai HospitalJuravinski Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMedicineMSH2CancerInternal medicineOncologyCancer registryIncidence (geometry)Lynch syndromePopulationCohortCumulative incidenceColorectal cancerDNA mismatch repair

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Previous studies assessing breast cancer risk in families with Lynch syndrome (LS) have yielded conflicting results. Furthermore, conclusions are limited by small sample size and few breast cancer outcomes. This study assesses breast cancer risk in a large prospectively followed LS cohort. Methods Pedigrees of 325 unrelated families with LS within the Familial Gastrointestinal Cancer Registry in Canada were examined for breast cancer diagnoses. Standardised incidence ratios (SIR) and lifetime cumulative incidence calculations were used to compare the incidence of breast cancer in mutation carriers with the general population. Results Forty-one mutation carriers diagnosed with breast cancer belonging to 34 unrelated families were identified. Mean age at diagnosis was 54 years. The mutation distribution among the LS patients with breast cancer was statistically different from those without breast cancer (p=0.015), reflecting the predominance of MSH2 mutations among affected patients (74%). Eighty-eight per cent of LS families with breast cancer met Amsterdam criteria, compared with 49% of LS families without breast cancer (p=0.03). Lifetime cumulative incidence of breast cancer in female MSH2 mutation carriers in our cohort was 22% (p<0.001). The SIR for breast cancer of female MSH2 mutation carriers in our cohort was 3.11 (95% CI 1.95 to 4.71). Conclusions An increased risk of breast cancer in MSH2 mutation carriers was demonstrated in a Canadian familial cancer registry. Women with breast cancer often had a personal and family history of multiple LS-related malignancies. These results suggest a potential role for intensified breast cancer surveillance among women with LS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,067

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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