Methylation Profiling RIN3 and MEF2C Identifies Epigenetic Marks Associated with Sporadic Early Onset Alzheimer’s Disease
Notice bibliographique
Résumé
A number of genetic loci associate with early onset Alzheimer’s disease (EOAD); however, the drivers of this disease remains enigmatic. Genome wide association and in vivo modeling have shown that loss-of-function, e.g., ABCA7, reduced levels of SIRT1 and MEFF2C, or increased levels of PTK2β confer risk or link to the pathogenies. It is known that DNA methylation can profoundly affect gene expression and can impact on the composition of the proteome; therefore, the aim of this study is to assess if genes associated with sporadic EOAD (sEOAD) are differentially methylated. Epi-profiles of DNA extracted from blood and cortex were compared using a pyrosequencing platform. We identified significant group-wide hypomethylation in AD blood when compared to controls for 7 CpGs located within the 3’UTR of RIN3 (CpG1 p = 0.019, CpG2 p = 0.018, CpG3 p = 0.012, CpG4 p = 0.009, CpG5 p = 0.002, CpG6 p = 0.018, and CpG7 p = 0.013, respectively; AD/Control n = 22/26; Male/Female n = 27/21). Observed effects were not gender specific. No group wide significant differences were found in the promoter methylation of PTK2β, ABCA7, SIRT1, or MEF2C, genes known to associate with late onset AD. A rare and significant difference in methylation was observed for one CpG located upstream of the MEF2C promoter in one AD individual only (22% reduction in methylation, p = 2.0E-10; Control n = 26, AD n = 25, Male/Female n = 29/22). It is plausible aberrant methylation may mark sEOAD in blood and may manifest in some individuals as rare epi-variants for genes linked to sEOAD.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».