A persistently infecting coronavirus in hibernating Myotis lucifugus, the North American little brown bat
Notice bibliographique
Résumé
Bats are important reservoir hosts for emerging viruses, including coronaviruses that cause diseases in people. Although there have been several studies on the pathogenesis of coronaviruses in humans and surrogate animals, there is little information on the interactions of these viruses with their natural bat hosts. We detected a coronavirus in the intestines of 53/174 hibernating little brown bats (Myotis lucifugus), as well as in the lungs of some of these individuals. Interestingly, the presence of the virus was not accompanied by overt inflammation. Viral RNA amplified from little brown bats in this study appeared to be from two distinct clades. The sequences in clade 1 were very similar to the archived sequence derived from little brown bats and the sequences from clade 2 were more closely related to the archived sequence from big brown bats. This suggests that two closely related coronaviruses may circulate in little brown bats. Sequence variation among coronavirus detected from individual bats suggested that infection occurred prior to hibernation, and that the virus persisted for up to 4 months of hibernation in the laboratory. Based on the sequence of its genome, the coronavirus was placed in the Alphacoronavirus genus, along with some human coronaviruses, bat viruses and the porcine epidemic diarrhoea virus. The detection and identification of an apparently persistent coronavirus in a local bat species creates opportunities to understand the dynamics of coronavirus circulation in bat populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».