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Enregistrement W2746094872 · doi:10.1242/dev.154864

<i>Pitx1</i> directly modulates the core limb development program to implement hindlimb identity

2017· article· en· W2746094872 sur OpenAlexafffund
Stephen Nemec, Maëva Luxey, Deepak Jain, Aurélie Huang Sung, Tomi Pastinen, Jacques Drouin

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill UniversityMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyHindlimbLimb developmentCore (optical fiber)AnatomyComputational biologyGeneticsGeneEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Forelimbs (FLs) and hindlimbs (HLs) develop complex musculoskeletal structures that rely on the deployment of a conserved developmental program. Pitx1, a transcription factor gene with expression restricted to HL and absent from FL, plays an important role in generating HL features. The genomic mechanisms by which Pitx1 effects HL identity remain poorly understood. Here, we use expression profiling and analysis of direct Pitx1 targets to characterize the HL- and FL-restricted genetic programs in mouse and situate the Pitx1-dependent gene network within the context of limb-specific gene regulation. We show that Pitx1 is a crucial component of a narrow network of HL-restricted regulators, acting on a developmental program that is shared between FL and HL. Pitx1 targets sites that are in a similar chromatin state in FL and HL and controls expression of patterning genes as well as the chondrogenic program, consistent with impaired chondrogenesis in Pitx1−/− HL. These findings support a model in which multifactorial actions of a limited number of HL regulators redirect the generic limb development program in order to generate the unique structural features of the limb.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,721
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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