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Enregistrement W2746096857 · doi:10.1093/ofid/ofx163.1880

Torque Teno Virus (TTV) and Epstein–Barr Virus (EBV) Viral Load in Peripheral Blood as a Biomarker of “Net Immunosuppression”: Factors Influencing Viral Load in Adult Patients Awaiting Solid Organ Transplantation

2017· article· en· W2746096857 sur OpenAlexaff
Jutta K. Preiksaitis, Curtis Mabilangan, Yupin Tong, Catherine Burton, Simon Urschel

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTorque teno virusMedicineImmunosuppressionViral loadImmunologySerologyVirusCytomegalovirusSalivaInternal medicineVirologyGastroenterologyHerpesviridaeGenotypeViral diseaseAntibodyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative measurement of DNA levels of persistent highly prevalent viral infections such as Torque Teno Virus (TTV) and Epstein–Barr Virus (EBV) that are highly dependent on T-cell responses for control have been proposed as possible biomarkers of “net immunosuppression.” We examined factors influencing TTV in 51 adult patients awaiting solid organ transplantation (15 kidney, 15 liver/small bowel, 10 heart, 11 lung) and 51 healthy age- and sex-matched controls. Samples from all patients were tested for TTV DNA (plasma) using quantitative nucleic acid testing (QNAT), EBV and cytomegalovirus (CMV) serology, CMV DNA (QNAT of plasma, urine, saliva), and EBV DNA (QNAT of whole blood [WB], saliva). Effects of age, sex, organ, CMV serology, and EBV DNA on TTV DNA were explored in univariate and multivariate models. Patients and controls were well-matched for age (median 48.4 vs. 49.2 years), sex 64.7% M, both CMV seropositivity (45.1% vs. 51%) and EBV seropositivity (94.1% vs. 98.0%), and detection of EBV DNA in saliva (52.9% vs. 50.0%) and WB (28.6% vs. 16.3%). TTV DNA was detected more frequently and at higher levels (Figure 1) in patients (86.3%) vs. controls (66.7%). TTV DNA plasma levels were age-dependent for patients but not controls (<50 years vs. >50 years, P = 0.021), and were only higher in patients >50 years vs. controls (P = 0.003). Only two patients and no controls had CMV DNA detected. Neither CMV serostatus nor sex impacted TTV DNA levels in patients or controls. Patients awaiting lung transplant had lower TTV levels compared with those awaiting liver (P = 0.04) or heart transplant (P = 0.03). A significant correlation between plasma TTV DNA levels and WB EBV DNA (r = 0.28, P = 0.05) but not saliva EBV DNA levels was observed in patients (Figure 2); only WB EBV DNA level was a significant predictor of high (≥3rd quartile of control) TTV DNA levels in patients in multivariate analysis (P = 0.026). Four of the five patients tested before and 27–285 days after transplant had a significant post-transplant rise in TTV DNA levels (Figure 3). Measurement of TTV DNA in plasma alone or combined with EBV DNA in WB may be a useful marker for measuring global immunosuppression including age-related immunosenescence in subjects not receiving exogenous immunosuppression. All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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