Identification and characterization of NAGLU mutations in a Sanfilippo B syndrome patient with a novel genotype (p.Y140C/p.R297X)
Notice bibliographique
Résumé
Background: Sanfilippo B syndrome, or mucopolysaccharidosis type IIIB (MPS IIIB), is a rare lysosomal storage disorder resulting from mutations in NAGLU, which encodes for the enzyme α-Nacetylglucosaminidase (NAGLU). Patients afflicted with this disease experience mild somatic disease symptoms, but severe and ultimately lethal neurodegeneration. Patients often succumb to their symptoms in the first two decades of life. Sanfilippo B syndrome is a molecular heterogeneous disorder, in which nonsense and missense mutations frequently result in a genetic compound genotype, leading to the disease phenotype. Case Report: We report a novel compound heterozygous genotype (p.Y140C/p.R297X) in a Sanfilippo B patient. The level of NAGLU activity assayed from cultured skin fibroblasts was 0.6% of normal, confirming the biochemical diagnosis of Sanfilippo B syndrome. Immunoblot analysis using an anti- NAGLU antibody showed that the amount of NAGLU protein present was about 50% of normal. Conclusion: We have identified a novel genotype p.Y140C/p.R297X in a patient with Sanfilippo B syndrome that results in near zero NAGLU enzyme activity. We postulate that the nonsense mutation p.R297X produces either an unstable mRNA transcript or truncated protein that is rapidly degraded, whereas the missense mutation p.Y140C results in a stable but catalytically defective enzyme with near zero residual NAGLU activity. We conclude that the p.Y140C/p.R297X genotype is likely to result in a poor prognosis due to a detrimental biochemical phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».