Prevalence and genetic variability of Plesiomonas shigelloides in temperate climate surface waters of the Pannonian Plain
Notice bibliographique
Résumé
Plesiomonas shigelloides, a Gram-negative bacterium and the causative agent of intestinal diseases and extraintestinal infections in humans and animals, is most frequently found in aquatic environments in tropical or subtropical areas. The present study was designed to establish the prevalence and genetic variability of P. shigelloides in surface waters (lakes, rivers, ponds, inlets and canals) located in a temperate climate zone, namely the Pannonian Plain of the northern part of Serbia and southern part of Hungary. The strains were isolated directly by plating samples on inositol-brilliant green-bile agar with neutral red or phenol red as indicators. Our results indicate that phenol red effectively facilitates differentiation of P. shigelloides from other bacteria. A number of samples were enriched using alkaline peptone water broth, peptone inositolbile broth and tetrathionate broth. The recovery of the isolates was more successful with the first medium. Out of a total of 51 water samples collected from 28 different locations, 22 samples (43.1%) were found positive for P. shigelloides. Among the 37 isolated strains, 34 were from lakes (Satrinci, Ludas, Panonija, Krivaja, Pecs, Kapetanski rit, Pavlovci, Kovacsszenaja, Dobrodol, Vranjas, Borkovac, Hermann Otto, Sot, Selevrenac, Zobnatica, Palic, Orfui, Jarkovci, Conoplja) and 3 were from rivers (Danube, Sava). The strains were identified by phenotypic characteristic or by the VITEK2 system and confirmed by PCR using 23S rRNA species-specific oligos. The strains showed a high genetic variability, displaying a variety of RAPD profiles. Our results reveal for the first time a high prevalence of genetically diverse P. shigelloides populations in surface waters located in the temperate climate of central and southeastern Europe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,005 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».