The Time of Origin and Genetic Diversity of Three Isolated Kokanee Populations in Southwest Alaska
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We examined the time of origin and genetic diversity of native kokanee, the nonanadromous ecotype of Sockeye Salmon Oncorhynchus nerka, from three isolated lakes in the Katmai National Park and Preserve in southwest Alaska. These kokanee evolved independently from Sockeye Salmon when migration barriers arose, blocking ocean access. We used information about the relative age of each barrier to hypothesize the relative time of origin for kokanee in each lake. In addition, we used data from 13 microsatellite loci to test our time of origin hypotheses and assess genetic diversity of kokanee from these three lakes and proximate Sockeye Salmon populations. Coalescent‐based estimates of the time of origin for kokanee in Jo‐Jo Lake (170 years before present [ybp]) and Devil's Cove Lake (6,583 ybp) were consistent with the relative age of barriers isolating each lake. However, data from Dakavak Lake (1,379 ybp) suggested that the barrier was older than hypothesized. Indices of intrapopulation diversity were lower for kokanee than for Sockeye Salmon. Estimates for kokanee population divergence (RST; the FST analog for microsatellites) among the three lakes were consistent with time of origin estimates. Furthermore, the most recently isolated kokanee (Jo‐Jo Lake population) were most closely related to neighboring Sockeye Salmon. Only the kokanee from Jo‐Jo Lake exhibited a relatively low historical effective population size (Ne ≈ 107) and evidence of a genetic bottleneck. Taken together, the results of this study show that although rare, kokanee in Alaska are not ephemeral and can persist in isolation for hundreds of generations despite the colder temperatures and shorter growing season, that are thought to limit their sustainability in Alaska.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».