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Enregistrement W2746987263 · doi:10.1093/ve/vew036.014

A15 Rapid radiation of treponema pallidum pertenue in wild non-human primates

2017· article· en· W2746987263 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueVirus Evolution · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune responses and vaccinations
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTreponemaBiologyNon-humanVirologyZoologySyphilis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteria of the species Treponema pallidum are causative agents of venereal syphilis (Treponema pallidum pallidum), Bejel (T. p. endemicum), and yaws (T. p. pertenue) in humans. We documented Treponema pallidum infections associated with disease in wild sooty mangabeys (Cercocebus atys) in Taï National Park, Côte d'Ivoire, and green monkeys (Chlorocebus sabaeus) from Bijilo Forest Park, Gambia and Niokolo-Koba National Park, Senegal. To examine the evolutionary relatedness of these treponemes to those responsible for diseases in humans and for previously documented infections in baboons (Papio papio), we conducted a hybridization capture experiment to enrich Treponema pallidum DNA from samples collected from symptomatic individuals. This approach allowed us to sequence the full genomes of Treponema pallidum strains infecting sooty mangabeys (n = 2) and green monkeys (n = 4). Phylogenomic analyses revealed that all Treponema pallidum strains infecting non-human primates are most closely related to the sub-species T. p. pertenue. Strains infecting humans and non-human primates do not appear to be reciprocally monophyletic. The star-like phylogenetic branching pattern of the T. p. pertenue clade, with short basal branches receiving low statistical support, suggests a rapid initial radiation across humans and non-human primates. These results greatly broaden the known host range of T.p. pertenue and suggest the existence of a vast zoonotic reservoir that could possibly contribute to the failure of global eradication efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,884
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle