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Enregistrement W2747323340 · doi:10.1038/s41467-017-00404-y

Phytochrome-interacting factors directly suppress MIR156 expression to enhance shade-avoidance syndrome in Arabidopsis

2017· article· en· W2747323340 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesInstitute of Botany, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of Agricultural SciencesChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésShade avoidancePhytochromeArabidopsisBiologyCell biologyGenePhenotypePromoterArabidopsis thalianaFar-redPhototropismGene expressionGeneticsMutantBotanyBlue lightRed light

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plants have evolved a repertoire of strategies collectively termed the shade-avoidance syndrome to avoid shade from canopy and compete for light with their neighbors. However, the signaling mechanism governing the adaptive changes of adult plant architecture to shade is not well understood. Here, we show that in Arabidopsis, compared with the wild type, several PHYTOCHROME-INTERACTING FACTORS (PIFS) overexpressors all display constitutive shade-avoidance syndrome under normal high red to far-red light ratio conditions but are less sensitive to the simulated shade, whereas the MIR156 overexpressors exhibit an opposite phenotype. The simulated shade induces rapid accumulation of PIF proteins, reduced expression of multiple MIR156 genes, and concomitant elevated expression of the SQUAMOSA-PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE (SPL) family genes. Moreover, in vivo and in vitro assays indicate that PIFs bind to the promoters of several MIR156 genes directly and repress their expression. Our results establish a direct functional link between the phytochrome-PIFs and miR156-SPL regulatory modules in mediating shade-avoidance syndrome.Plants employ developmental strategies to avoid shade and compete with neighbors for light. Here, Xie et al. show that phytochrome-interacting factors, which are regulated in a light-dependent manner, directly repress MIR156 genes and promote the expression of SPL genes to enhance shade-avoidance responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,796
Score d'incertitude au seuil0,686

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle