P3–419: Identification of presenilin–associated proteins and potential regulators of the gamma–secretase complex
Notice bibliographique
Résumé
The presenilins, NCT, aph–1 and pen–2 form a series of high molecular weight complexes that are necessary for gamma– and epsilon–secretase cleavage of selected Type 1 transmembrane proteins, including APP, Notch and cadherins. However, questions concerning the biology of the presenilin complexes remain to be resolved. These include how their activity is modulated in terms of substrate specificity, what are the relative activities of the gamma– and epsilon–sites, and whether or not additional proteins in the presenilin complexes might subsume these putative regulatory functions. To investigate the possible presence of additional co–factors, we sought to apply an in situ cross–linking method that maintains the microenvironment of the presenilin complex. PS1 immuno–affinity purification using a novel in vivo formaldehyde cross–linked has been used in wild–type and PS1/ PS2 double knockout blastocyst–derived cells. This has revealed that all four known constituents of the presenilin complex (nicastrin, aph–1, pen–2 and PS1) were present as shown by mass spectrometry. A few other possible candidates were also identified in the immunoprecipitates from wild–type cells. We are following up on that the confirmation experiments on their interaction with presenilin complex by co–immunoprecipitation, glycerol velocity gradients and on native/2D gel chromatography. This has been complemented by functional examination of gamma–secretase activity by determination of Abeta and ICD production in whole cells and cell–free gamma–secretase assays. This has led to the identification of several potential modulators of the presenilin complex that may have functional significance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».